食品的化学污染来源广、品种多、成分复杂，主要包括农药残留物、各种有害金属和非金属，以及其他污染物如亚硝基化合物、多环芳烃类化合物等；滥用食品添加剂，使用有毒的食品容器及包装材料等也可造成化学性污染。

化学性污染物对人体的危害有急性危害、慢性危害和远期危害。急性中毒时表现为集体性食物中毒，其污染物有农药、金属铅、铜、砷、汞等慢性中毒主要发生在砷、汞、镉等金属的长期摄食。远期危害主要表现为致畸、致癌、致基因突变的“三致”后果。

化学性食物中毒的发病率仪次于细菌性食物中毒。最常见的是因农药、化肥、鼠药、亚硝酸盐及镉、铅、砷等有毒化学物质大量混入食品所致。这类食物中毒的症状比较严重。

另外，还有放射性污染，如使用放射性物质的生产活动和医疗、科学实验的放射性废物排放，以致超过安全限量造成对人体健康的危害。但是，在现代家庭居室中的装饰材料、地面使用的大理石等也含有一定的放射性物质，也应引起足够的重视。