该时期，河南省对高等教育投资政策执行情况的监督检查不断完善。在制度上，省教委或省教委联合相关部门先后制定、出台了《河南省高等学校财务管理若干规定》（1995）、《河南省教委省级教育事业费管理办法》、《委直单位财务管理办法》（1998），使学校的经济活动有章可循、有法可依，从制度上增强了对高校的宏观调控能力，规范了学校的经济行为。

在组织上，1997年3月，河南省教委成立“河南省豫教审计师事务所”，同年5月，省教委监察室挂审计处牌子[4]，从此，省教育行政管理部门设立了专门的审计机构，为审计、监督高等教育投资政策执行、经费使用奠定了组织基础。1997年、1998年，省教委连续两年举办了“河南省教育系统内审工作会议暨全省教育审计处（科）长培训班”，旨在进一步加强教育系统的内部审计工作。

省教委、相关行政管理部门、各高校主要开展了年度审计和专项审计，对高等教育投资政策执行和经费使用进行监督检查。如省教委会同省审计部门对郑州大学等13所高校在1993年度的收支情况进行审计，审计总金额1.4亿元，查出违规金额2000多万元。1995年，以河师大、郑大、农大和财院为试点单位，开展了对基建工程的审计监督，取得了显著成效。[5]1996年，完成了高校及委直单位的预算外资金清理检查工作。同年6、7月，对全省高校及委直单位的预算外资金进行全面的清理检查，自查面达100%，查出违纪收入156万元，违纪支出9万元，小金库资金3万元。[6]1997年省教委印发了《关于对委属高校1997年科技经费使用和管理情况进行审计调查的通知》，对科技经费相对较多的7所高校的科技经费管理使用情况进行抽查，摸清了高校科技经费拨款渠道及科研项目的报批情况。[7]

[1] 《河南教育年鉴》编纂委员会.河南教育年鉴1994[R].郑州：河南教育出版社，1995：106.

[2] 《河南教育年鉴》编纂委员会.河南教育年鉴1996[R].郑州：河南教育出版社，1997：136.

[3] 河南省教育厅财务处.历年回顾［EB/OL］.http：//jyck.haedu.gov.cn/ArtShow.jsp？Id=23，2008-01-28.

[4] 《河南教育年鉴》编纂委员会.河南教育年鉴1998[R].郑州：河南教育出版社，1999：311.

[5] 《河南教育年鉴》编纂委员会.河南教育年鉴1996[R].郑州：河南教育出版社，1997：146.

[6] 《河南教育年鉴》编纂委员会.河南教育年鉴1997[R].郑州：河南教育出版社，1998：120.

[7] 《河南教育年鉴》编纂委员会.河南教育年鉴1999[R].郑州：河南教育出版社，2000：301.