2006年9月15日，日本最高法院决定驳回邪教组织奥姆真理教教祖麻原彰晃(原名松本智津夫)辩护律师的特别上诉，维持东京地方法院对麻原的死刑判决。2004年2月，东京地方法院对麻原作出死刑判决，他的辩护律师随即向东京高等法院提出上诉，但此后又以被告精神失常为由要求法院暂停上诉程序。2006年3月27日，东京高等法院认定被告具有应诉能力，做出不接受被告有关暂停上诉程序要求的决定。根据日本法律，日本最高法院驳回被告提出的特别上诉后，东京地方法院做出的死刑判决将被执行。

1995年3月20日上午8时10分左右，日本东京地铁三条线路的五节车厢同时发生被称为“沙林”的神经性毒气泄漏事件，造成12人死亡、5000多人受伤。由于放在五节车厢中的11个可疑物均在上班高峰时间同时泄漏毒气，而且又多集中在政府机构所在的霞关车站，所以该恐怖事件被认为是针对政府而来。

经过紧急调查，警方认为奥姆真理教是肇事者。两天以后，2500名身穿迷彩服、头戴防毒面具的警察机动队员在装甲车的配合下，对位于东京都、山梨县、静冈县等地25处奥姆真理教的道场、医院、工厂等设施进行强制性搜查。呼啸的警车、全副武装的警察接连不断出现在家家户户的电视屏幕上，整个日本列岛笼罩在恐怖的气氛中。虽然搜查之前，警察当局并没有掌握奥姆真理教与地铁毒气事件有直接联系的证据，但该教团的活动早被警方所注意。1994年6月，长野县松本市曾出现过毒气伤亡事件，当时有7人死亡，多人受伤，事后警方取样化验是“沙林”毒气泄漏所致；7月在山梨县上九一色村奥姆真理教的设施周围又两次出现恶臭事件，当地居民为此与该教团发生纠纷，警方后来查定恶臭是制造“沙林”毒气产生的有机磷化物气味，此后警方进一步发现该教团拥有大量制造“沙林”毒气所需的原料。1995年3月18日，当局决定4天之后对奥姆真理教在关东地区的有关设施进行搜查，但消息泄露，奥姆真理教连夜将东京本部的大部分物品转移到其他地方。3月26日，警方从该教团在上九一色村的建筑物中搜出能够制造几十吨“沙林”的化学原料。就在警方拼命寻找该教团与地铁毒气事件有关的证据时，3月30日，负责调查其事的警察厅长官在自己住宅门口被职业杀手开枪袭击，身负重伤，凶手却骑着自行车逃之夭夭。事后警方接到神秘电话，要求停止对毒气事件的调查。

警方一方面以绑架罪在全国各地继续追捕重大嫌疑犯，另外还以各种名目逮捕奥姆真理教的高级干部。由于该教团教祖预言4月15日东京将要发生更大事件，因而警方在4月14日出动大批人马对奥姆真理教在全国30个都道府县的130个据点和设施进行全面搜查。第二天警视厅出动1万名警官部署在霞关官厅街、永田町国会所在地、新宿及涩谷繁华地区进行严密警戒。尤其在新宿车站附近，商店停业，行人稀少。更让人惶恐的是，有报警电话声称奥姆真理教将在自来水管道中投放毒药，一时人心惶惶。尽管当日没有发生任何异常现象，但到4月19日横滨车站又出现毒气事件，数百人受害。之后在横滨百货商店、前桥饮食店、新宿车站洗手间又有毒气或毒物被发现。5月15日晚，新横滨地铁车站再次发生异臭气体事件。

警方随后断定地铁毒气事件是奥姆真理教所为，并逮捕其上百名成员。澳大利亚联邦警察局5月11日证实奥姆真理教成员曾在澳大利西部一牧场进行过毒气试验。5月12日，该教被捕的“化学班”头目承认自己曾参与制造“沙林”，是该组织成员第一次做出这种承认。5月14日，该教已被捕的另一位成员承认，他在3月20日凌晨把装有“沙林”毒剂的塑料袋放入了地铁。15日晚，东京警视厅以杀人嫌疑对东京地铁毒气事件祸首、奥姆真理教头目麻原彰晃正式发出逮捕令。16日，麻原在自己的老巢——山梨县上九一色村的“真理6号”建筑物内被捕。

奥姆真理教的创始人麻原彰晃，1955年生于九州熊本县八代市，因视力极弱而进入熊本市内县立盲人学校就读，并因家庭贫困一直领取学校奖学金。高中毕业后受过两年按摩及针灸训练，后考东京大学不中。结婚后在千叶县开设药房，1982年因未经许可生产、贩卖中成药被捕。1984年麻原创办奥姆神仙会，1986年麻原到印度会见达赖喇嘛，自称得其真传。1989年奥姆真理教正式登记成为宗教法人，以瑜伽、特异功能、超自然神秘现象和世纪末思想吸引信徒。

1990年2月，以麻原为首的25名奥姆真理教干部以“真理党”的名义参加众议院议员选举，耗资2亿日元而无一人当选，竞选失败是麻原及其教团走向极端的转折点。麻原著书立说，论述1997年将发生第三次世界大战及其毒气战争将带来世界末日，他还以各种手段聚敛财富，购置地产、建设道场、修工厂、生产化学物品和武器，并从俄国购置了军用直升机和检测毒气的仪器，还准备购置坦克和自动步枪等武器。

奥姆真理教的巨额财富主要来自信徒的捐献，该教规定一旦成为其信徒，个人拥有财产要全部奉献给教团，奥姆真理教内部除教祖、正大师、正悟师等宗教等级外，还模仿日本政府机构设立了大藏省、外务省、邮政省、劳动省、粮食厅等20个省厅，其中谍报省大臣由麻原六岁的女儿担任。

死后归教团所有，教团甚至以绑架、监禁、注射迷幻药的手段迫使那些不情愿的信徒奉献财产。

奥姆真理教利用各种形式劝诱青年男女入教，除高等学校的毕业生外，自卫队、警察也是该教团发展的主要对象。警方搜查奥姆真理教有关设施的消息就是该教团在自卫队的信徒透露出去的。奥姆真理教内部除教祖、正大师、正悟师等宗教等级外，还模仿日本政府机构设立了大藏省、外务省、邮政省、劳动省、粮食厅等20个省厅，其中谍报省大臣由麻原六岁的女儿担任，建设省、自治省、防卫厅是该教团的战斗部队，负责麻原教祖的警卫，从事恐怖活动，绑架和监禁企图脱离教团者等工作。奥姆真理教除在国内有1万名信徒外，还积极向海外发展。在波恩、莫斯科、纽约都设有支部，其中以莫斯科支部为最大，信徒达3.5万人。该教团在俄罗斯设有电台，东窗事发后，俄罗斯当局已下令禁止奥姆真理教在俄罗斯的活动。

尽管麻原彰晃被捕并被审判，但教团继续存在。2000年1月，奥姆真理教改名为“阿莱夫”，仍秉承奥姆真理教的“教义”和“修行”体系。2004年2月，麻原被东京地方法院判处死刑时，该组织声称在日本仍有1650名教徒。

在日本历史上，每当社会发生急剧变化时均会出现新兴宗教，例如19世纪中期的幕府末期明治维新初期、20世纪20年代的大正末期昭和初期、20世纪20年代的战后初期占领时代等。奥姆真理教出现的20世纪90年代前后，正是日本社会急剧变化时期，泡沫经济形成及其崩溃使人们难以适应这种变化，纷纷进入虚幻世界躲避，特别是那些被社会所排挤的弱者和游离于社会集团外部的人群是新兴宗教团体的热心支持者。

另外值得注意的是，奥姆真理教、阿含宗、世界真光文明教团、真如苑、幸福科学这些被称为“新新宗教”与过去的宗教团体不同，没有完善的教义，多靠特异功能、超能力、神秘化以及“末世观”吸引信徒。特别是随着科学技术的发达，管理性社会使人性受到较大的制约，价值观、世界观处在混乱状态，因而那些非合理的、神秘的学说对年轻人有较大的吸引力。确实如此，“新新宗教”信徒不多，但年青且高学历者居多，容易走火入魔，轻易成为反社会、反体制、反人类的邪教。

日本更是如此，集团主义色彩浓厚的传统文化，使战后日本社会的行为主体——中央官厅、政党、大银行、大企业、大商社也成为一个个封闭式的教团组织，它以研修的形式对新进社员进行洗脑，一旦加入某一团体就难以脱身，全体成员穿同一服装，甚至行为也整齐划一。在经济日益发达、职业日益分化、价值观亦多样化的今天，个性化的追求欲望与集团主义原则发生矛盾，使得本来就缺乏价值判断标准的青年，为填补精神空白而投入充满极端妄想的宗教团体，便不是什么不可思议的事情。