徐世昌总统既然已下令通缉罪魁，便不再给段派留情面，又陆续下令，罢免湖南督军兼长江上游总司令吴光新所有职位，所有吴光新旧时管辖军队由王占元妥为接收。同一天，削夺吴炳湘原官位及勋位、勋章。过了几天，即八月三日，又下令解散安福俱乐部。
到撤换王揖唐的时候，徐世昌总统已不直接下令，而是由国务院电致江苏，将王揖唐的议和代表一职立即撤销，改派江苏督军李纯为南北议和全权总代表，与广东军政府接洽和议。李纯本就与王揖唐有嫌，于是发了一篇弹劾王揖唐的电文，电达中央。徐总统下令，“王缉唐勾煽军警，多方图乱，除已由国务院撤销总代表外，着即褫夺军官，暨所得勋位、勋章，由京外各军民长官依法惩办。”王揖唐寓居上海，虽然距京较远，但消息却很灵通，得知中央要查办他，立即窜入上海租界内。
徐总统答应曹锟、吴佩孚要求，眼下除新旧国会未见有明文解散外，其余已一律照办。但是曹锟、吴佩孚痛恨的是徐树铮，徐与段芝贵、曾毓隽等匿居日本使馆，曹、吴一定要日本人交出，按法惩办，所以立即呈请徐总统，请与日使馆严重交涉。徐总统命外交部照会外交团，索要祸魁徐树铮等十人。外交部直接致文到日本使馆，问有无收留。日本公使据实答复，承认徐树铮等人在日本使馆内，并得到外交保护。外交部接到日使复文，当即致书日使，请求引渡。日使却拒绝引渡，将徐树铮等人视为政治犯，容纳保护。经日使两番拒绝，徐总统也无可奈何。即使曹、吴痛恨小徐，也不能亲自到东交民巷中把他捉来，二人只好忍气吞声，暂时搁置。
直、奉两派并力推倒段派，自然格外亲近。由两派军官代为撮合，曹、张二人联为婚媾。张有庶子，为二姨太所生，曹有庶女，也为二姨太所出，年龄都很小，好似一对金童玉女。后来张家行聘，曹家受聘，两家结为姻亲。
第三师师长吴佩孚因时局纠纷，连年未定，想召开国民大会，解决时局。当下草订大纲八条：一、定名为国民大会；二、由国民自行招集，不得用官署监督，以免官僚政客操纵把持；三、取国民自决主义，凡统一善后及制定宪法，与修正选举法及一切重大问题，均由国民解决，地方不得借口破坏；四、由全国各县农、工、商学各会各举一人为初选所举之人，不必以各本会为限。如无工、商会，宁缺毋滥；再由全省合选五分之一，为复选。等各省复选完，齐集天津或上海，成立开会；五、由省县农、工、商、学各会长互相监督，官府不得干涉。六、先由各省农工商学总会共同组织，为该省总事务所，再由总事务所电知各县农工商学各会，剋日成立各县事务所。办事细则由该所自订。七、经费由各省县自由开支。八、三个月内成立，开会限六个月，将第三条所列诸项议决公布后闭会。且吴佩孚还主张将南北新旧国会一律取消，南北议和代表一律裁撤，所有历年纠纷均由国民公决。
吴佩孚这番论调，全国四万万同胞没有一个不赞成的。试想中国自革命以来，既已改君主为民主，应该将全国主权授诸国民全体，为什么袁世凯要设筹安会，想做皇帝？为什么徐树铮等人要组建安福部，想包揽政权、财权、军权？这些行为都为全国民心所不愿。结果是袁氏失败，洪宪皇帝只做了八十三天，终归无成。徐树铮频年借款，频年练兵，也弄得一败涂地，寄身日本使馆。可见军阀们硬夺民权，终究是拗不过民心。民心所向，事必有成；民心所背，事无不败。吴佩孚师长既有此主张、议案，岂不是中华民国的一大曙光？无奈他曲高和寡，言与心违，所以“国民大会”四字仍是梦中幻想。又何况推倒段祺瑞，权归曹锟、张作霖，曹、张也是武力主义，哪里顾什么国民不国民？
西南一带又是党派分歧，粤、桂、滇、黔各系忽合忽分，谁都想扩充地盘，把持权力。四川省地肥美、民殷富，不愧为长江上源的金穴，军阀你争我夺，搅得乱七八糟，周道刚被刘存厚撵走，刘存厚被熊克武挤走，至直、皖战后，熊克武又被吕超排出，川军推举吕超为总司令。熊克武心有不甘，到刘存厚处请援兵，再入川境。川民连遭兵祸，倾家**产。其他如滇、黔、桂、粤各派分裂以后，也是兵戈相见。此外，各省督军、师长表面上虽没有争扰，暗地里却都怀着私谋。因此，要实行民权主义谈何容易？
段派失势，靳内阁复兴。靳云鹏由曹锟、张作霖推举，徐总统特别任命，再次担任国务总理。靳氏二次登台，更想收揽时誉，力谋和平，他特请徐总统不咎既往，赦免安福部余支。随后靳氏又想履行前议，为南北统一计划，请命总统，召曹、张两使到京，商决时局问题。曹锟、张作霖各乘专车入都与靳相见，三人聚在一堂，和气融融。随后经徐总统下令，裁撤四川、广东、湖南、江西四省经略使，改任曹锟为直鲁豫巡阅使，与张作霖职权相同，副使就由吴佩孚升任。张作霖与吴佩孚虽有些猜忌，但此时还没什么恶感，所以中央超擢吴氏，张没有异议。但吴主张的国民大会却被张作霖极力排斥，说政府自有权衡，用什么国民大会。于是靳云鹏将张的意思转告吴佩孚，硬是将吴佩孚的一时伟议打消了。靳提议的南北统一，张作霖表示赞成。曹锟是个没有主张的人物，立即同声附和，让靳全力去做。两巡阅使驻京半个月，分电各省督军，采集时议。各督军派遣代表聚集天津，曹、张就此出京，由靳云鹏送到天津。当下，曹、张与各省督军代表晤商了一夜。各代表都是顺风敲锣，谁敢持异议？曹、张喜气洋洋，分道自归原镇，靳总理立即回京，各代表也全部回本省去了。
靳云鹏总理回京以后，想立即实行南北统一的计划，但因南方军阀党派之间已决裂，所以此次议和比前次还要困难。滇、黔、粤、桂各成仇敌，旧国会一部分议员离粤赴滇，自开国会。最后，议决取消岑春煊政务总裁职务，补选贵州督军刘显世为政务总裁。刘当时被广东军政府选入，未曾就职，仍与唐继尧唇齿相依，不愿合入桂系。经北京靳总理及南北议和总代表李纯督军一再电劝，敦促和平，唐、刘二人才通电各省。电文似乎有条有理，一点不存私见，于是北方各省军阀家都复电表示赞同。