朱棣夺取皇位对明朝政治产生了深远的影响，但同时也给明朝的北部边防留下隐患。为了夺取和巩固皇权，朱棣借助边防力量，使之调头向南，塞王的内迁，北京的经营都是为着巩固统治和对付国内的反对势力。朱棣的地位巩固了，北部边防却空虚了。
随着国内秩序的稳定，朱棣把重点转移到控制四夷的宏伟事业上来，为的是做一个超迈千古的盖世雄王。然而，他的蒙古政策，不论是在政治上还是在军事上都失败了，北部边防的空虚，困扰了明朝近二个世纪。
朱棣以一隅之兵争天下，首先必须安定后方，巩固地盘，并需要扩大自己的力量。安定后方，有两点十分重要，一是号称“善谋”,实力仅次于燕王的宁王朱权不要做梗；二是鞑靼诸部不要乘机捣乱，如果能争取他们加入自己的营垒则更好。
燕王“靖难”之后做了三件事，徙宁王南昌，徙行都司保定，割大宁之地。朱棣不惜削弱北部边防以夺取和巩固皇位，为此也付出了沉重的代价。
朱棣无法逃脱丢弃大宁的责任。
朱棣以塞王起家，十分了解拥兵守塞的诸王的力量，因而对之小心戒备。除燕王外，塞上之王以宁王朱权的势力最大。同燕王一样，宁王也有争夺皇位的野心。朱棣做了皇帝，宁王就成了最危险的人物。宁王要求徙封内地，正中朱棣下怀。但宁王请苏州、钱塘皆不获准，终于徙封南昌。
如果明成祖不是有意放弃大宁，在内徙宁王之后完全可以保留原大宁都司卫所以戍守之，大宁都司迁于北京城南之保定，其卫所亦散置于北京周围而于原大宁之地却完全不设防，显然是有意放弃大宁。
朱棣怀柔远人的政策是一贯的，问题在于，为什么明知兀良哈之不可靠，却还要从大宁撤防呢?朱棣第三次北征，以兀良哈“党逆”,曾回师击之，为什么不因而恢复在大宁的防御设置呢?和田氏说：朱棣“出师未捷而崩于榆木川，重置大宁之志未得酬现”。试想，以朱棣“五出漠北，三犁虏庭”之威，以南征交趾，远出外洋之盛，是完全有能力恢复大宁的，不必临死再为之嗟叹，因而，毋宁说朱棣就根本没有“重置大宁之志”!
朱棣是以普天下之主自居的，他自认为四海一家，无分内外，兀良哈与任何异族异类一样都是他的臣民，对于那些殊方远夷朱棣尚可不分彼此，厚往薄来，对于有功靖难的兀良哈格外眷顾就十分自然了。
应该说朱棣自己并不认为是放弃了大宁，因而也便无须有“重置大宁之志”。问题在于朱棣的这一四海一家的宏伟构想，在国力强盛、君主有为之时尚可维持一定局面，而一旦国力削弱，主暗臣庸，非只“天下一家"不可能实现，就连近在咫尺的边陲之地也难以控制了。历史事实已经证明朱棣好大喜功，大而无当反不及朱元璋的稳扎稳打来得可靠。
在蒙古地区脱离中原政权的控制时期，大宁可以说是明朝边防的战略要地。其时，大宁与宣府、辽东并列为第一道防线，朱元璋又命徐达西自古北，东至山海修关隘一道，为第二道防线。因此，控制大宁，对于驾驭兀良哈、女真，遏止鞑靼东进是十分重要的。
为了经营大宁，朱元璋执政时就花费一番苦心。洪武二十年(1387),为了对付纳哈出，朱元璋下令筑大宁、宽河、会州、富国四城，并驻兵防守，随之，设大宁都指挥使司及大宁中、左、右三卫，并以木榆、会州、新城等卫隶之。洪武二十四年(1391),宁王就藩大宁，又增置卫所十余处。朱元璋甚至在大宁卫设立儒学，教授武官子弟，设教授训导， “仍选识达达字者教习达达书”,并“颁经书，以广文教”。这些，在朱棣下令拔大宁于保定后，全被取消了，大宁“遂为空城”。朱元璋的心血，被朱棣做皇帝的野心和大而无当的规划淹没了。
兀良哈三卫设于洪武二十二年(1389),而“久之皆叛去”。“靖难之役”后，朱棣虽加意笼络， “欲使受国恩，永为外藩，共享太平之盛”。但兀良哈三卫“当成祖之世已烦驾驭”,不时剽掠边地屯堡，甚至与本雅失里合谋寇边。因此，放大宁虽贻患后世，但永乐年间就已显出祸端。
大宁之弃，使辽东到宣府的防御线被切断了。而且，大宁既弃，开原逼塞不可居，不得不将韩王朱松改封平凉。再加上东胜诸卫迁于内地，开平迁于独石，北边第一道防线完全崩溃，只有靠近北京的第二道防线可守。自是“诸夷列我险阻，闯我门庭，要我官员，残我吏民”, “畿辅之间骚然多事矣”。永乐以后的边患，不少与兀良哈有关，加之国都迁于北京，其威胁益显严重。
明朝许多有识之士，看到这种局面潜伏着更大的危险，有练兵振武之谋，有恢复大宁之议。大学士丘浚指出： “京师东北藩离单薄之甚，异时卒有外患，未必不出于此。”明末东北边警频仍，完全证明了丘浚的这一预见。
在内迁辽王的同时，朱棣又将谷王从宣府。辽王从广宁内迁。塞王内迁，固然解除了诸王对皇位可能构成的威胁，但也大大削弱了北边的防卫力量。这样，就形成了国都靠近前线，天子坐镇守边的局面。尽管朱棣雄心勃勃，长驱远驾，扬威塞外，但北部边防退缩的格局已难以改变。
朱棣的措置失当留于后世，极大地影响了明朝政权的稳固。明末清初，不少人追究明朝灭亡的责任，都不免要归罪于朱棣。傅维鳞说： “太宗定鼎幽燕，居外驭内，南面以临海宁。独迫在边陲，则守御为艰。然而大宁之内徙三卫之外向，独石之孤悬，丰胜之沦没，抚今追昔，宁无叹慨!而况于数千里严疆，一旦波沉陆海，则明季边臣之偷玩，有不忍言者。而迹其始境，宁不罪有所归哉!"