朱由检信任特务的具体办法，便是将一切军政大权交给特务去管理监督，已有的特务机构，尽量加强，已经停办的机构，重新再设。
加强厂卫侦缉
其实如东厂和锦衣卫这两大特务机关，朱由检对它始终是十分信任的。《明史·刑法志三》称：
庄烈帝即位，忠贤伏诛，而王体乾、王永祚、郑之惠、李承芳、曹化淳、王德化、王之心、王化民、齐本正等相继领厂事，告密之风未尝息也。
而《明史·陈龙正传》卷二五八亦称：
时政尚综核，中外争为深文以避罪，东厂缉事尤冤滥。
这种“冤滥”情形如李清《三垣笔记》上所载：
予初入刑垣，郑司寇三俊（万历戊戌建德人）获谴归时，予就寓谒问：“刑部何事最冤？”三俊惨然曰：“无过盗情，若欲平反，不过云秋后处决尔。”予愕然曰：“何谓？”三俊曰：“此皆从东厂缉获者，司官不敢反，堂官何繇反？惟择无赃无证情可矜疑者，缓以秋决，或可从容解网也。”相与叹息久之。
予初入刑垣，闻东厂盗最冤，每厂役获盗，必加以五毒，择肥而攀，俟罄掳既饱，然后呈厂。厂上疏皆历历有词，不四日便下部拟，不十余日便依样招奏，又不四日便会官处决。曾有一盗赴市，太息云：“我贼也不曾做，如何诬我为盗？”一日，予晤刑部一司官，以平反劝，惨然曰：“不敢。”予曰：“何也？”对曰：“天下有一介不取之官，而无一介不取之吏，若一翻厂招，异日借题罗织，官吏并命矣。”一时干和招灾，莫此为甚。
对这种“告密”“冤滥”，朱由检是予以鼓励的。王之心、曹化淳都曾因缉奸之功，荫弟侄锦衣卫百户，而崇祯十四年九月且改称东厂提督为总督，以重其权。(11)
因为如此，所以那时厂卫横暴，也不下于魏忠贤时代，钱谦益云：
今上（由检）龙飞，召用时相（按：指温体仁）……用其私人掌卫事（按：即体仁义子董琨），属锻炼起大狱，略约如逆奄用显纯故事。(12)
甚至比魏忠贤时还厉害：
乌程（温体仁）之忮毒，深于逆奄，董琨之周内，精于显纯。(13)
至于那时厂卫缉事的横暴情形，《明史·刑法志三》所记甚详：
庄烈帝疑群下，王德化掌东厂，以惨刻辅之，（吴）孟明掌卫印，然观望厂意，不敢违。而镇抚梁清宏、乔可用朋比为恶，凡缙绅之门，必有数人往来踪迹。故常晏起早阖，无敢偶语，旗校过门，如被大盗，官为囊橐，均分其利。京城奸细潜入，佣夫贩子，阴为流贼所遣，无一举发。而高门富豪，跼蹐无宁居。其徒恣行请托，稍拂其意，飞诬立构，摘竿牍片字，株连至数十人。
这种踪迹“缙绅之门”，那时虽以宰辅之尊亦不能免，如其时阁臣薛国观便为东厂害死。其实薛国观也不是个好东西，他曾劝朱由检加紧厂卫侦缉，反说当时厂卫尽力不够，这样便得罪了东厂太监王德化。于是便专门侦缉他的阴事，他的仇人吴昌时也勾结了东厂理刑吴道正，揭发了他的贪贿情形，因此朱由检便免了他的官。国观出都回家，重车累累，侦缉的人又报告上去，而东厂派到国观官邸伺察的人，又得到他招摇通贿情状，于是便把国观逮回缢死。(14)还有周延儒之死，也是由于特务的侦缉。当时锦衣卫使骆养性与中官勾结，专察延儒阴事。及至延儒罢归，养性还不放松，天天说他的坏话，终于又逮回，勒令自尽。(15)
薛周两人阴险贪暴，也和特务差不多，杀死原不足惜。只是特务们的陷告，并不是因为他们贻误国事，而是由于私仇或是争宠。同时这两个人的奸诈，当时也有很多朝臣弹劾，朱由检都不采纳，而特务一言，便予罪死，由此可见当时特务的威势以及朱由检信任特务之专了。
厂卫之势如此，底下爪牙更是横行无忌。这些爪牙是和流氓地痞勾成一气的，流氓做他们的外围，帮着打听事件，打听来以后，特务们便拿点钱给他们，叫做“买事件”。但是，哪有这么多事件可打听呢？在朱由检时，这些流氓便去诱人为奸，制出事件，卖给特务。崇祯十五年御史杨仁愿便上疏说到这事：
功令比较事件，番役每悬价以买事件，受买者至诱人为奸盗而卖之，番役不问其从来，诱者分利去矣。挟忿首告，诬以重法，挟者志无不逞矣。(16)
以上大多是东厂情形，至于当时锦衣卫呢，其侦察罗织之凶，也并不下于东厂，如：
上寄耳目于锦衣卫，称为心膂大臣，托采外事以闻。吴金吾孟明，缓于害人而急于得贿，其子邦辅尤甚，每缉获州县送礼单，必故泄其名，沿门索赂，赂饱乃止，东厂亦然。尝有某知县送银二十四两求胡编修守恒（崇祯戊辰舒城人）撰文，时尚未受，亦索千金方已。一时士大夫皆重足而立。(17)
至于奉令出去逮人的时候，更是百端地勒索敲诈。底下的一个实例，是崇祯十三年锦衣校尉奉旨赴南昌逮黄道周时的情形：
旗尉至南昌，阖郡惶惧，姚知府面送公礼五百金，又私礼三百金，伙长袁从先一百金，又锦衣酒席折程折席共三十金，又分犒金吾管家及长随六十二十余金。(18)
逮到京以后，自然是下诏狱拷打，有的往往就这样被打死。有时朱由检下密旨叫锦衣卫使在狱中暗地杀人。如姜埰、熊开元因言事下狱，“帝怒两人甚，密旨下卫帅骆养性，令潜毙之狱。养性惧，以语同官。同官曰：‘不见田尔耕许显纯事乎？’养性乃不敢奉命”(19)。这件事王士祯《池北偶谈》卷五记载较详：
骆养性字泰如，京师人，崇祯朝为大金吾，熊鱼山开元姜如农埰二公俱以直言得罪，下锦衣狱。一日漏下二鼓，一小中官持怀宗御笔至云：“谕骆某，即取熊姜二犯绝命缴。”骆附缴奏旨，略云：“言官虽有罪。常明正典刑，与天下共弃之，今昏夜以片纸付臣杀二谏官，臣不敢奉诏。”帝怒为之霁。
而据熊开元自己所记则是：
二十九日召对，既罪刘宗周等，独谕金吾骆养性曰：“熊开元必有主使，不行拷讯，是汝不忠。”骆方出，沉吟道上，中使忽以手敕至，则令“取开元、埰毕命，以病闻。”密诏也。骆失色，语同列，同列曰：“是何可杀？珰党乱政时，田尔耕毙诸言者足鉴也。”明□十二□□取开元百端拷掠，求主者，但举一腔义愤，及姻朋辈私相感叹，俛开元勿语者以对。先一拶一百敲，又一夹打五十棍，掠至垂毙，始还狱。初二日又一夹打五十棍，复去衣，打四十棍，自分死矣。金吾法已穷，思之三日，似有鬼神之通，乃以所谳无大碍于首辅者，为一纸，开元所供娓娓千言为一纸同进。并缴书密谕曰：“诚如圣谕，天下只畏臣衙门之刑，不畏朝庭之法，合无将开元发部拟罪，肆诸市朝，始可昭垂后世。”初四日，上以谳词发阁，延儒叩首曰：“熊开元南人不任刑，今已至矣愿付刑曹。”上用其言，下部，且手诏答金吾曰：“开元、埰前诏不必行。”始惊且喜，呼圣明也。(20)
朱由检这种行为，简直和魏忠贤时代一模一样了。
第五章曾经说过朱厚熜喜欢亲自指挥特务打问臣下，朱由检也是如此。如吴昌时就在他面前被打断腿：
蒋拱宸疏参宜兴及吴昌时，内有“通内”一事，为上所最忌。七月二十五日，召府部九卿科道廷鞫，上角素，率太子与定王同讯。呼昌时前，诘其通内，上声色俱厉。昌时辩：“祖宗之制，交结内侍者斩，法极森严，臣不才，安能犯此？”上呼蒋拱宸面质，拱宸战栗，匍伏不能措一语。上愈怒，叱退拱宸。然上意已有成局，不待拱宸之对质也。昌时始终不为屈，曰：“皇上必欲以是坐臣，臣何敢抗违圣意？自应承受，若欲屈招，则实不能。”上即命内侍用刑，阁臣蒋德璟、魏操德出班奏曰：“殿陛之间，无用刑之例，伏乞将昌时付法司究问。”上曰：“此辈奸党，神通彻天，若离此三尺地，谁敢据法从公勘问者？”二阁臣奏：“殿陛用刑，实三百年未有之事。”上曰：“吴昌时这厮，亦三百年未有之人。”二阁臣口塞，叩头而退。内臣遂进，用夹，两胫皆绝，昏迷不省人事。乃命下锦衣卫狱。昌时已不能行，卫役负之以出。(21)
而那时蒋拱宸说话触犯了由检，由检曾怒“喝声‘打’，司刑者将拱宸当头一下，纱帽为裂”(22)。横暴至此，也真是少见的了。
至于其时厂卫缉事的一般情形，自然更是作威作福，无中生有，如崇祯十年；
逮福建兴泉兵备曾樱。厂卫缉事，缉得曾樱营升事状，有旨逮问。樱申辩无此事，人役书札皆伪也。(23)
特务有时还设法拆阅他人信件，作为报告材料。如：
（给事中杨）时化方忧居，通书（户部尚书）孙居相，报书有“国事日非，邪氛日恶”语，为侦事者所得，闻于朝。帝大怒，下居相岳，谪戍边。七年卒于戍所。(24)
这样侦缉真可以说得上无孔不入了，但就凭这样，由检还觉得不够，还自己直接派遣特务出去侦缉。如薛国观刚罢职的时候，他便曾派人在国观住所密伺：
当国观初罢，上令人潜伺有何人先至其寓。中书王升彦往焉，遂执赴诏狱。(25)
又如以袁崇焕事逮钱龙锡入狱，审问时，他也派人去密探。黄宗羲《南雷文约》卷一《大学士机山钱公神道碑》云：
公至廷，辩侃侃，上密遣人诇其语。
这些密探全由他直接指挥，连厂卫都不知道，他们侦缉得极其周密，极小的事也都报告上去：
有郡守缺，部推某任子，上曰：“郡守牧民，当简循良，某以市茶不当意，挝碎奴子首，岂可治郡耶？”部臣惊愕，出访之，果有此事，以为得自诇者，询之缉事之人，渠曰：“我辈钩察，皆关于钱粮重事……若家人诟谇，何从问之？”即诸内侍亦惊诧相顾，不知何以达圣聪也。(26)
这些密探，京师以外，由检也都派遣得有。如：
（两广总督熊）文灿官闽、广久，积资无算，厚以珍宝结中外权要，谋久镇岭南。会帝疑刘香未死，且不识文灿为人，遣中使假广西采办名，往觇之。既至，文灿盛有所赠遗，留饮十日。(27)
至于厂卫缉事这样专横，当时也有人向庄烈帝奏谏，无如他信任过深，都不采纳。如兵科给事中庄鳌献于崇祯六年上太平十二策，极论东厂之害，竟犯了忤触，且因之贬官。(28)而杨仁愿在前引的奏疏末后也说：“伏愿宽东厂事件，而后东厂之比较缓，东厂之比较缓，而后番役之买事件与卖事件者俱可息，积重之势无几可稍轻。”后来他又曾切言缇骑不当遣，说是“缇骑一遣，有资者家产破散，无资者地方敛馈，为害滋甚”(29)。这回朱由检算是在表面上敷衍了一下，“为谕东厂，言所缉止谋逆**，其作奸犯科，自有司存，不宜缉，并戒锦衣校尉之横索者”。但事实上呢，《明史》就在这几句话后面接着叹道：“然帝倚厂卫益甚，至国亡乃已。”(30)
经济特务及其他
以上都是朱由检信任厂卫特务的实例，此外他又还派遣许多特务到各个政治、经济、军事部门中去做侦缉工作。如那时的太监张彝宪便是个大财政特务。
张彝宪是司礼太监，为人极有心计，朱由检疑心户部和工部有舞弊情事，崇祯四年九月便叫他去钩校这两部的钱粮出入，并且特地替他建立衙门，名曰“户工总理”。当时诸臣如给事中宋可久、冯元飚等十余人上章论谏，吏部尚书闵洪学率朝臣具公疏力争，朱由检全都不听。(31)于是张彝宪便按行两部，坐在尚书之上，时人滑稽地称之为“堂公堂婆”(32)。工部侍郎高弘图受不了这侮辱，不肯为之下，便上言云：
臣部有公署，中则尚书，傍列侍郎，礼也。内臣张彝宪奉总理两部之命，俨临其上，不亦辱朝廷而亵国体乎？臣之为侍郎也，贰尚书，非贰内臣也，国家大体，不可不慎。故仅以川堂相宾主，而公座毋宁已之，虽大拂彝宪意，臣不顾也。且总理公署，奉命别建，则在臣部者，宜还之臣部，岂不名正言顺而内外平？(33)
但是朱由检认为军饷事重，应该到部验核，不听。而且将高弘图削去官籍斥归。
到崇祯七年二月张彝宪便更进一步竟请求天下入觐官投册，以隆体统。由检也居然允许了他。于是，山西提学佥事袁继咸便上疏云：
士有廉耻，然后有风俗，有气节，然后有事功。如总理户工太监张彝宪有请令入觐官投册以隆体统之奏，皇上从之，意在厘奸剔弊，非欲群臣屈膝也。乃上命一出，靡然从风，藩臬守令，参谒屏息，得免苛责为幸。嗟呼，一人辑瑞，万国朝宗，而相率趋拜内臣之座，士大夫尚得有廉耻乎？国家自有觐典二百余年，未闻有此，可为叹息也。(34)
奏上以后，朱由检说他“越责言事”，予以切责。同时张彝宪也上疏奏辩，说是“觐官参谒，乃尊朝廷”，于是继咸又上疏驳斥：
尊朝廷莫大于典例，知府见藩臬行属礼，典例也；见内臣行属礼，亦典例乎？诸臣入觐，投册吏部，典例也；参谒内臣，亦典例乎？事本典例，虽坐受犹可以为安；事创彝宪，即长揖只增其辱。高皇帝立法，内臣不得预外事。若必欲以内臣绳外臣，会典所不载。(35)
这第二疏奏上以后，得到的仍是切责。后来杨士聪曾对此有所论断，说得很好：
张彝宪之总理户工二部，所司不过稽核，非有出纳之寄也。且初时尚坐部堂，迨自立署，绝不至部，朝觐各官即有钱粮相关，遣吏投册可矣，乃相率而诣之，行见部礼，至于考选各官，以功名所系，趋之尤急，拜伏堂下，了不知耻，异日翱翔言路，责其风节，不亦难乎？(36)
张彝宪在任上第一件事便是排斥异己，如工部尚书曹珖因部堂设坐事和他闹得很僵，于是彝宪便“日捃抚其隙。会山永巡抚刘宇烈请料价万五千两，铅五万斤，工部无给银例，与铅之半。宇烈怒，奏铅皆滥恶。彝宪取粗铅进曰‘库铅尽然’，欲以罪珖。严旨尽熔库铅，司官中毒死者三人，内外官多获罪。彝宪乃纠巡视科道许国荣等十一人，珖疏救，忤旨诘责。彝宪又指闸工冒破（左齿右奇）龁之。珖累疏乞骸骨归，五日得请。”(37)
张彝宪除了排斥异己而外，便是贪污纳贿，剥削人民，从不曾去认真核验什么军饷。比如他到任以后，故意勒扣边镇军器不发，借以索贿(38)。又请催天下所欠赋税一千七百余万(39)。一则贻误军机，一则结怨人民，这就是特务验核军饷钱粮的成绩。
这两件事当时也有人向朱由检论谏，如管盔甲主事孙肇兴劾张彝宪误国，给事中范淑太言欠赋不当催。但朱由检都不采纳，且将孙氏问罪充军。以后，凡是谏论的人都被斥去。甚至周士朴以工部尚书地位，不赴彝宪期，也遭罢斥。信任一个特务，竟不惜牺牲这许多臣下，这个君还不是个亡国之君吗？
朱由检时的著名经济特务除了张彝宪之外，还有个杨显名。《烈皇小识》卷五：
（崇祯十年四月）上命太监杨显名总理两淮盐课，显名抵任，查参巡盐张养、高钦舜各侵匿税额几十万，有旨逮问。时养已卒，命籍其家。
显名在任上，朱由检也是命令当地监司以下向他行下属之礼：
上遣中使杨显名监鹾政，令监司以下行属礼。(40)
此外，如崇祯六年“命司礼太监张其鉴等赴各仓，同提督诸臣盘验收放”，七年“命兵部同内中军张元亨、崔良用往西宁监视及茶马御史易壮马”，九年“命司礼太监曹化淳同法司录囚”，十四年“司礼太监王德化奉命率群臣习仪于太学”。(41)至于军事方面所派的特务就更多，当于下节详述之。
特务的威焰
至于当时特务们的威焰，更是炙手可热。他们可以随便诬陷官吏，有一次竟将京师附近各县县官一齐诬陷革职：
上传任丘、清苑、涞水、迁安、大城、定兴县知县白慧元等“贪酷纵虐，俱着革职提问。抚按官不行纠劾，溺职殊甚，近畿如此，远地可知，着部院申饬。”(42)
这事的起因说起来也十分可笑：
慧元令任丘，珰某，任丘人也。邀慧元饮，酒半，尽陈诸宝玩以供鉴赏。慧元曰：“我有至宝，大异于是。”珰问何宝？慧元笑而不应，珰固问之，慧元曰：“我腰下有至宝耳。”珰默然。遂罗织其事款入告。又虑其修私怨也，并罗及清苑等县。(43)
他们不但诬陷一般官员，就是以尚书之尊，得罪了他们，他们也照样地可以在朱由检面前将他排斥掉，甚至还加以侮辱。如戎政尚书李邦华曾欲稽核京营，“遂为内侍飞语所中，罢任去。去国之日，守门群奄争捽击之，至于裂其衣冠，辱其妻孥”(44)。还有一次，竟率领多人径自搜查官员住宅，而且胡乱栽诬：
固安知县秦士奇，一日公退在衙，有抚按所遣推官带从人叩门而入，则都察院咨行奉旨搜查本官私宅者也。将妇女驱至闲处；据室倾倒筐箧，搜得银七百两，坐赃论戍。究其所以，乃士奇得罪于本县大珰，入毁言于上，故出其不意而为此也。无论七百重赀，但以所有坐赃，亦非法甚矣。是时上新诛魏忠贤，而复用珰言如此！(45)
官员既可随意栽诬，老百姓自然更可以随意屠杀了。如：
金光辰……崇祯元年……擢御史，巡视西城。内使周二杀人，牒司礼监捕之。(46)
此外，他们便是千方百计地索贿赂，被索的人如若不给，便有吃不尽的苦头。如：
令百官进马，三品以上各贡一匹，余合进，俱纳于御马监，实赉金贸易之本监也。否则，虽骏骥亦却之。(47)
又如：
杭州解到龙段三万匹，内奄索贿不遂，驾言不中用，令票旨驳还。(48)
而当时官员们如果和他们拉拢得好，有罪也可以变成无罪。如陈新甲便是：
陈新甲……迁宁前兵备佥事……及城破，坐削籍。巡抚方一藻惜其才，请留之，未报。监视中官马云程亦以为言，乃报可。(49)
后来他做了兵部尚书，仍和宦官特务勾结很紧：
（陈）新甲雅有才，晓边事，然不能持廉，所用多债帅。深结中贵为援，与司礼王德化尤昵，故言路攻之不能入。(50)
于是一班无耻官僚，便纷纷向他们逢迎谄媚、曲意奉承，无所不至了。如：
珰某与小襄城及秀水诸人善。珰有母称寿，秀水拉诸同人往贺。甫登其堂，则珰母已巍然端坐，珰侍其旁，曰：“太太年老，不能行礼，小弟代为答拜。”即先下拜。秀水辈相顾错愕，不得已，顿首再拜而起。(51)
甚至，恬不知耻地形之奏章。如崇祯十年七月工部员外郎方玺上言：
皇上亲擒魏忠贤而手刃之，岂溺情奄竖者，不过以外廷诸臣无一可用，而借才及之。况人臣苟知报答，何论内外？内臣既徼兹旷典，孰不欲弃捐顶踵，以酬我皇上者？不必鳃鳃过计也。(52)
特务这样地横行，主子这样地信任，朝臣又这样地谄媚，形成了特务高于一切的局面，这还不足够亡国而有余吗？