总体而言20世纪的后二十年是日本文化研究的蓄势期，新世纪以来为爆发期，其间还可以发现若干变化趋势。就研究目的而言，学界经历了从被动了解日本向全面客观研究日本并形成中国研究特色的变化。就对日本文化的价值判断而言，经历了从单向憧憬褒扬到全面客观考察探求殷鉴的变化。不过，综观学界相关“殷鉴论”的研究，并没有影响学者们认知日本文化的客观性，而只是对此前一味褒扬之声的矫正，因为只有理性的学术研究才能对研究对象做出综合客观的评价，这也证明了中国的日本文化研究趋向理性和成熟。

关于存在的问题。首先，是有不少研究论题和观点重复雷同，有太多的泛泛之谈。其次，各研究领域的进展不平衡，比如宗教类中的神道研究成果颇丰，佛教研究显得势单力薄，而真正的道教研究甚至还没有起步。再次，就国际学术交流而言，与日本学界交流频繁且受益颇多，但与欧美学者的交流还没有全面展开。出现这些缺陷的原因固然很多，但学界研究的分散状态应该是重要原因之一。迄今为止，国内还没有一个具有实质性、全国性的日本文化研究学术团体，除中华日本哲学会比较活跃之外，其他领域大多各自为战，缺乏亲密接触式的学术交流。此外，也没有类似《现代日本经济》那样的日本文化研究的专门刊物。为克服上述短板，使今后的研究更加合理化、系统化、规模化，创办全国性专业学会和刊物，应该是亟待解决的问题。