日本在1907年8月解散朝鲜地方各道的镇卫队时，就派军队到京畿、江原、忠清三道，10月间除加强13道警察机构外，更由国内运来重兵在各道要地设置守备队进行“讨伐”义兵。日本帝国主义者“讨伐”的残忍毒辣是中国人民所熟悉的，他们的目标不仅对准义兵，而且对居民集中的地点进行有计划的“扫**”，疯狂屠杀人民，强奸妇女，放火烧毁整村的房屋，抢走粮食。在日军的“三光政策”下，朝鲜人民遭受了史无前例的浩劫。据官方缩小了的材料，1908年一年中被屠杀的爱国者就有11 562名，仅忠清北道一道1907年8月到12月末5个月间被烧毁的房屋即达1078户，乡校45所。江原道洪川郡7个“面”（相当我国的区）被烧房屋352户。从当时的《皇城新闻》透露出来的消息，可以看到凡是日军“扫**”过的地方，“无辜人民悉丧失家园，流浪无告，产业归于灰烬……秋收无望，寒期日迫，居处无着，妇孺啼饥号寒，不胜凄凉”。以后长期斗争的年代里，日寇对朝鲜人民的掠夺、屠杀、**、凌辱，更无法统计了。[218]

日本的烧杀政策丝毫不能消灭朝鲜军民的斗志，相反的，增加了人民更深的仇恨，义兵运动愈来愈带上群众性，使日寇剿不胜剿。如全罗南道鹿岛256个居民留下老妇一人，全部参加了义兵部队。黄海道方面，袭击文化郡的义兵80多人，在战斗中又有矿工和铁路运输工人参加进来，汇合到200多人袭击了信川郡。广大人民热烈支持义兵，供应物资和人力的事例更多。[219]

在斗争中，日寇完全陷于孤立，人数少时甚至不敢走出铁路沿线以外。日本侵略者唯一的办法是：实行朝鲜人打朝鲜人的政策。1908年6月就招募4065名朝鲜人当日本宪兵补助员，同时收买和利用朝奸，打入义兵内部进行破坏。在日寇指使下，一进会会员在各地强迫人民组织“自卫团”，断绝人民与义兵的联系，用“拒绝加入的就是和义兵一党”的恐吓来威胁居民参加自卫团。朝奸替日军作间谍和翻译，到处进行迫害和掠夺人民，朝鲜人民用更广泛而顽强的游击战争回答了敌人。

义兵运动一直继续到朝鲜被并吞以后，据日本官方缩小的材料，从1907年到1911年即义兵运动最活跃的5年间，参加斗争的人数和斗争次数如下：

其中义兵战死者16711名，负伤者36770名。[220]这尽管是官方缩小了的数字，仍可以看出义兵规模的浩大，斗争的英勇和自我牺牲的精神。1910年8月，日本并吞了朝鲜，实行宪兵警察的“武断政治”。日军放弃以前的“大讨伐”的战术，采取在全国各地同时进行“小讨伐”各个击破的方法，对义兵进行了更残酷的扫**。1911年后义兵部队由于武装的恶劣和组织上的原因，逐渐衰弱下去，深入山区活动。一部分义兵在中国东北的延边地区建立了反日游击战争的根据地，在国内和国外继续和日军作英勇的斗争，一直到1915年。这时义兵不仅进行武装斗争，并且向人民群众揭露日本帝国主义的殖民政策，进行反对日本经济掠夺的斗争。如1910—1911年，平安道宜川、博川、介川、成川、顺川、宁边等地人民，在义兵的领导下，袭击和烧毁当地的财务所、驻在所和邮局，展开反对缴税运动。

第一次世界大战爆发前后，义兵中的一部分以与中国东北交界的国境线和苏联沿海州为中心，进行独立军运动。独立军由小部队构成，进行分散性的斗争；在国外设立军官学校，培养军事干部，派遣一部分人员到国内袭击破坏日本宪警机构，杀掉一些殖民者和民族败类，扰乱日本帝国主义在朝鲜的统治秩序。[221]