可是，最先有难的倒不是太子，而是明崇俨！调露元年（679年），洛阳爆出了一件人命大案，深受唐高宗和武则天宠信的术士明崇俨遇刺身亡！洛阳城一下子轰动了。一些迷信的人说，明崇俨为奉迎帝后，役使鬼神过于苛刻，因此被鬼杀了。但是也有政治敏感度高的人认为，明崇俨的死可能和太子有关。武则天怎么处理这件事呢？她马上立案调查，到处搜捕嫌疑犯，洛阳城几乎被翻了过来，但是，凶手始终不见踪影。其实，武则天心里明白，凶手不可能在外边，要找，也只能在太子宫里找。可是，调查太子，需要有借口。武则天也不是第一次办这样的事情了，她最擅长的就是跟踪调查，隐忍不发，捕捉战机。一个是处心积虑找机会，另一个却是浑然不觉无防范，时间一长，李贤的把柄终于出现了。
当时有位东宫官员，上书劝谏太子不要纵情声色。李贤有什么不规矩的表现呢？具体说来，就是他当时搞起了同性恋，宠幸一个叫作赵道生的奴隶，和他同床共枕，俨然一对情侣。为了讨好小情人，李贤赏给他大量金银财宝，就跟当年高阳公主对和尚辩机一样。这种风化问题在李唐皇族子弟中本来是平常事，就像《红楼梦》里贾母说的：“小孩子馋嘴猫似的，谁打小都从这么过来着。”可是武则天看到了这份上书的价值，她决心利用好这条线索。因此，虽然看起来顶多是一个风化问题，武则天还是立刻上报给唐高宗，说这涉及太子的道德形象，要求立案调查—她要从这里打开缺口！
事情关涉太子，谁来调查呢？级别太低当然不行，所以只好由宰相披挂上阵了。当时的宰相一共有八个，有四个是武则天刚刚提拔上来的，和太子的关系都不牢固。其中有一个叫裴炎的，拜相前仅仅是一个四品官。这些人能够拜相全是托武则天的福，对于武则天自然也是感恩戴德，他们在站稳脚跟之前，都是武则天的同盟军。提拔低品级官员，利用他们来打击当权高官，一向是武则天的拿手好戏，现在还是故伎重施。于是，两位新提拔上来的宰相裴炎、薛元超和一位御史大夫高智周，一起组成了最高法庭。
既然是从风化案开的头，当然就从风化案审起。李贤的同性情人赵道生首先被提审。一顿大刑伺候之后，赵道生扛不住了，不仅招供了和太子之间的非法关系，还供出一个天大的秘密：他就是刺杀明崇俨的刺客！这么一来，案子的性质就变了，从一般的风化案上升到了谋杀案！既然是谋杀案，那就不能只看人犯证词，还要找到作案工具才行。那就赶紧找凶器吧。武则天立刻派人搜查太子府。结果就有了更惊人的发现—在东宫的马坊之中居然搜出了几百领甲胄！这可是一件天大的事情。因为按照唐朝制度规定，为了保障安全，任何人不得收藏像甲胄这一类的军用物资，必须交给专门的机构武库署保管。需要用的时候领出，用完再送还。私藏武器是犯法的。可是我们都知道，制度和实际运作往往有距离，常常有些军事单位用完了武器并不及时归还。太子的东宫拥有军队，因此存着一定数量的武器甲胄也并不算太离谱，可以作多种解释。但是，我们刚刚说过，审案的宰相是武则天提拔上来的，他们唯武则天马首是瞻。现在，是武则天决定把谋杀案再升一格，定性为谋反案！太子私藏武器，是阴谋夺权！
这个结果把唐高宗打蒙了，李贤已经当了太子，天下迟早都是他的，他为什么要谋反呢？唐高宗一向喜欢这个儿子，他向武则天求情了。注意，这已经是唐高宗第三次为谋反的亲属求情了：第一次是在高阳公主案中为他的哥哥和叔叔，第二次是为舅舅长孙无忌，这一次是为自己的亲生儿子。如果说，前两次他还有作秀的成分，那么这次可是真的了。但是，就像前两次求情被拒绝一样，这一次，武则天断然拒绝了他。武则天说：“为人子怀逆谋，天地所不容，大义灭亲，何可赦也！”
“大义灭亲”就是高宗这三次求情的共同结果。李贤被废为庶人，押送到长安囚禁起来。从东宫搜出来的甲胄被运往天津桥当众焚毁，昭告天下。审案的宰相裴炎和薛元超都受到了嘉奖，分别升任侍中和中书令，武则天在宰相之中的影响力又提升了一步。
小案做成大案，波及面就大了。既然是谋反，必定有党羽，一系列对武则天进一步提升不利的人都被牵连进来了。几位支持太子的宰相都很快被调离了岗位，一批和李贤有联系的宗室也被牵连，流放各地，甚至被逼死。
在所有的悲剧之中，最可怜的是李贤的下属高政。高政的祖父是长孙无忌的舅舅高士廉，因为长孙无忌的事情，高家已经受了不少牵连，有如惊弓之鸟。现在，高政又卷入太子谋反案了。怎么处理呢？武后轻描淡写地说了一句，得了，这也是国家的旧勋，祖先都是功臣，让他父亲教育教育他吧。早就吓破了胆的高家再也不敢招惹麻烦了，他们要用最冷酷的手段和逆子划清界限。高政刚一进门，他父亲就抽出佩刀刺进他的喉咙，紧接着，伯父又一刀捅进他的小腹，高政鲜血淋漓地倒在地上，他的堂兄随即又挥刀砍下他的头颅，然后把这具无头尸体扔到了大街上。人性的懦弱与卑微在高家表现得淋漓尽致，面对这样的臣子，连唐高宗都难以认同，而武则天心里却笑了：这样懦弱、卑鄙、没有血性的臣子，还不好对付吗！
经过这次清洗，太子李贤的势力基本被肃清，武后的权威也牢不可破地树立了起来。东宫不可一日无主，废李贤的第二天，武则天的第三个儿子英王李哲被立为皇太子，改元永隆，大赦天下。
面对武则天咄咄逼人的态势，风雨飘摇的李唐皇室还会面临怎样的变故呢？身为母亲的武则天已经“再摘使瓜稀”，对政治上极不成熟的李哲，她还会继续下狠手吗？