熊十力南下上海定居，得到了当时的上海市长陈毅的特别关心和帮助。当陈毅接到北京方面的通知，获悉熊十力抵达上海，马上派人帮助安排住房。在闸北青云路169弄91号有一幢两层楼的房子，熊世菩家在二层，楼下是另外一户。通过组织上出面做工作，楼下那家人被安排到了别处，熊十力和儿子住在了一起。
然而，这处房子临街而建，比较嘈杂，对于需要安静的熊十力来说，有些不堪其扰。所以，住了不多久，实在受不了的熊十力，给陈毅写了一封求助信，详细说明嘈杂的环境不利看书和写作，恳请市政府能够帮助调换住处。
陈毅当即亲笔回信，表示同意，并安排办公厅的同志速去办理。经过努力，办公厅的同志终于在上海淮海中路(旧霞飞路)找到了一座两层花园式小楼，这里宽敞、明亮，更关键的是安静。搬过去后，熊十力感到非常满意，对陈毅市长的关怀极为感谢。
自从熊十力住进淮海中路，陈毅市长在百忙之中，多次抽出时间特地前去看望。陈毅不仅是一位叱咤风云的革命家，同时也是一位满腹经纶的儒雅之士，在战火纷飞的年代，曾经留下许多脍炙人口的诗篇。
对于陈毅这样的儒雅将军，熊十力本来就有着亲近感，再加上陈毅多次帮助解决生活困难，更使得熊十力对陈毅有一种相见恨晚的感觉。尽管熊十力比陈毅年长16岁，尽管陈毅是高官，而熊十力仅为一介布衣，但是，丝毫没有影响到两人之间的交情。陈毅每一次看望熊十力，都会坐下来与之长谈数小时，有时谈国家形势，谈生产生活，有时谈哲学，谈诗词。在性格上，两人都是直爽之人，说话也都是直来直去，无所隐瞒。
有时候，陈毅因为太忙，担心看望熊十力的时间间隔太长，便嘱咐秘书，说：“我如果忙于工作，长时间没去看望熊先生，你就提醒我一下。”秘书遵照吩咐，隔一段时间，就提醒一次陈毅：“今天，您是否需要去看望熊先生？”
每当此时，陈毅就会一拍脑壳，说：“对啰，是该去拜见熊老夫子嘛。”
除了到熊十力家里看望，陈毅还经常请熊十力到自己家里做客，有鸡有肉地好生款待。熊十力倒也不客气，有请必到。每次回到家里，他总是很兴奋地对子女们描述做客经过，把陈毅的一些很风趣的谈话绘声绘色地进行转述。他曾不止一次地赞叹道：“陈毅市长真不简单啊！他从世家子第到将军，从诗人到军人，从戎并未投笔，文武双全，位居高巅，平易近人，真真难得啊！”
熊十力曾经向陈毅谈起自己心中的郁闷，说如今很少有人愿意找他谈学问了，尤其是过去的一些经常来往的老朋友，都怕戴上唯心主义的帽子，而不愿意与他过多接触。陈毅便在一次上海高校教师大会上讲：“听说有些人连熊十力那里也不愿意去，这很不好。熊十力先生才高八斗，其学问博大精深，是我们的国宝，你们要大胆地去向他问学，请教，不要怕这怕那，也不要怕别人说是封建迷信。”熊十力知悉陈毅的这番讲话后，非常激动，他说：“知我者，陈毅也！”说这话时，老人的眼角带着泪痕。
陈毅后来调中央工作，熊十力感到巨大的失落，不过，两人仍然保持着书信往来。
1956年2月，北京召开“两会”，熊十力和老友马一浮等人一同以特邀代表名义，列席全国政协知识分子会议。从上海到北京，一路上坐的是火车。熊十力有个很奇怪的习惯，不管多冷的天，都不让人关车窗。结果，大风直往车厢里灌，冻得随行的参会代表们都吃不消。等到了北京，这些人便跑到陈毅那里去“告状”，说熊十力简直太难侍候，并把一路上如何陪着熊十力挨冻的情况一五一十地说了。
陈毅听了，问那些人：“中国有几个熊十力？”
他们回答：“一个。”
陈毅批评道：“我们这么大一个国家，只有一个熊十力，你们就不能多动些脑筋好好照顾他吗？对像熊十力这样有很大影响的特殊学人，要特殊对待，特殊照顾。如果大家怕冷，你们完全可以给他买四张软卧票包一个车厢嘛。”
从此以后，每次到北京开会，熊十力单独被安排在一个车厢。这样，他可以自由地敞开车窗，尽情吹风，享受着“超等”待遇。
除了陈毅之外，周恩来、董必武等人也对熊十力关怀备至，每次开会，他们总会对熊十力嘘寒问暖。
由于年事已高，熊十力坐久了就不舒服，所以，每次开会，他明确表示，自己只保证“三到”，即开幕到、照相到、闭幕到，其他的时间，则在会务宾馆里看文件，或者会见友人。熊十力的这些特殊要求，最终都得到了满足。
不过，在1956年全国政协二届二次会议上，熊十力的另外一个“特殊化”表现遭到了毛泽东主席的批评，使得熊十力的“非主流”形象有所改变。
当时，由于北京的天气很冷，熊十力一直戴着一顶瓜皮帽。长袍马褂瓜皮帽，曾是清末民初读书人的标配，只是时过境迁，进入50年代，这种装扮已经显得相当地落伍了。可是，熊十力并不在乎，一直还保持着这副“非主流”装扮。那一天，政协会场里，就他一个人这副样子，毛泽东在主席台上看得清清楚楚，讲话的时候，便以熊十力的瓜皮帽说事：“我们什么人都有，解放这么多年了，还有人戴满清时代的瓜皮帽。”大家齐刷刷地把目光投向熊十力，搞得他尴尬不已。从此以后，他再也不戴那顶瓜皮帽了。也许，他觉得毛主席的批评是正确的，自己真的不能够与时代脱节。
1956年这一年，对于熊十力来说，可谓喜事连连，除了当选为全国政协委员，还被北京大学评为一级教授，工资从过去的200元涨到345元，每个月从由北京大学寄给熊十力，后来改由上海市政协发给。另一桩喜事，是他的另一部重要的国学专著《原儒》，由上海龙门书局出版，总共印了一千部。本来有6000元的稿费，但是，熊十力考虑到国家正处在经济困难时期，不打算领取稿费，后来经过有关负责人反复劝说，他才领取一半稿费。这部书是熊十力国际影响最大的一部著作，曾被中央政府作为国礼赠给印度、日本、苏联和东欧各国。