一、传统文献

（一）方以智著作

方以智：《通雅》，见《文渊阁四库全书》（第857册），台北：台湾商务印书馆，1983。

方以智：《物理小识》，见《文渊阁四库全书》（第867册），台北：台湾商务印书馆，1983。

方以智：《浮山文集前编》，复印罗炽教授藏手抄本。

方以智：《浮山文集后编》，见中国社会科学院历史研究所清史研究室编：《清史资料》第六辑，北京：中华书局，1985。

方以智：《浮山此藏轩别集》，见中国社会科学院历史研究所清史研究室编：《清史资料》第六辑，北京：中华书局，1985。

方以智：《性故》，复印刘贻群博士藏方以智六世孙宝仁录本。

方以智：《易余》，复印罗炽教授藏方以智六世孙宝仁录本。

方以智：《东西均》，李学勤校点，上海：中华书局，1962。

方以智：《东西均注释》，庞朴注释，北京：中华书局，2001。

方以智：《药地炮庄》，见《四库全书存目丛书》（子部第257册），济南：齐鲁书社，1997。

方以智：《药地炮庄》，张永义、邢益海校注，北京：华夏出版社，2011。

方以智：《一贯问答注释》上，庞朴注释，载《儒林》（第一辑），济南：山东大学，2005。

方以智：《一贯问答注释》下，庞朴注释，载《儒林》（第二辑），济南：山东大学，2006。

方孔炤、方以智：《周易时论合编》，见《四库全书存目丛书》（经21），济南：齐鲁书社，1997。

方以智：《冬灰录》，安徽省博物馆藏手抄本。

方以智等：《青原志略》，见《四库全书存目丛书》（史245），济南：齐鲁书社，1997。

方以智编：《青原志略》，张永义校注，北京：华夏出版社，2012。

（二）相关古籍

周敦颐：《周敦颐集》，陈克明点校，北京：中华书局，1990。

张载：《张载集》，章锡琛点校，北京：中华书局，1978。

程颢、程颐：《二程集》，王孝鱼点校，北京：中华书局，1981。

邵雍：《邵雍集》，郭彧整理，北京：中华书局，2010。

胡宏：《胡宏集》，吴仁华点校，北京：中华书局，1987。

黎靖德编：《朱子语类》，王星贤点校，北京：中华书局，1986。

朱熹：《四书章句集注》，北京：中华书局，1983。

陈献章：《陈献章集》，孙通海点校，北京：中华书局，1987。

曹端：《曹端集》，王秉伦点校，北京：中华书局，2003。

陆九渊：《陆九渊集》，钟哲点校，北京：中华书局，1980。

王守仁：《王阳明全集》，吴光、钱明等编校，上海：上海古籍出版社，1992。

吴震编校：《王畿集》，南京：凤凰出版社，2007。

吴可为编校：《聂豹集》，南京：凤凰出版社，2007。

徐儒宗编校：《罗洪先集》，南京：凤凰出版社，2007。

董平编校：《邹守益集》，南京：凤凰出版社，2007。

方祖猷等编校：《罗汝芳集》，南京：凤凰出版社，2007。

黄宗羲、全祖望：《宋元学案》，陈金生、梁运华点校，北京：中华书局，1986。

黄宗羲：《明儒学案》，沈芝盈点校，北京：中华书局，2008。

沈善洪、吴光编：《黄宗羲全集》，杭州：浙江古籍出版社，2005。

顾炎武：《日知录校释》，张京华校释，长沙：岳麓书社，2011。

王夫之：《船山全书》，长沙：岳麓书社，1996。

颜元：《颜元集》，王星贤等点校，北京：中华书局，1987。

吴光主编：《刘宗周全集》，杭州：浙江古籍出版社，2007。

施闰章：《施愚山集》，合肥：黄山书社，1992。

玄奘译，韩廷杰校释：《成唯识论校释》，北京：中华书局，1998。

慧能著，郭朋校释：《坛经校释》，北京：中华书局，1983。

法藏著，方立天校释：《华严金师子章校释》，北京：中华书局，1983。

真谛译，高振农校释：《大乘起信论校释》，北京：中华书局，1992。

实叉难陀译：《大方广佛华严经》（卷36），载《大正藏》（第10册）。

二、研究方以智的著作及论文

（按姓首字母顺序排序）

（一）著作

蒋国保：《方以智哲学思想研究》，合肥：安徽人民出版社，1987。

蒋国保：《方以智与明清哲学》，合肥：黄山书社，2009。

罗炽：《方以智评传》，南京：南京大学出版社，2001。

彭迎喜：《方以智与〈周易时论合编〉考》，广州：中山大学出版社，2007。

彭战果：《无执与圆融：方以智三教会通观研究》，北京：民族出版社，2012。

钱王刚：《方以智传》，合肥：安徽人民出版社，2008。

任道斌：《方以智年谱》，合肥：安徽教育出版社，1983。

任道斌：《方以智、茅元仪著述知见录》，北京：书目文献出版社，1985。

邢益海编：《冬炼三时传旧火：港台学人论方以智》，北京：华夏出版社，2012。

余英时：《方以智晚节考》（增订版），北京：生活·读书·新知三联书店，2004。

张永堂：《方以智》，载《中国历代思想家》第37册，台北：台湾商务印书馆，1978。

（二）期刊论文

陈卫平：《方以智对中西文化的比较》，《江淮论坛》1993年第2期。

陈卫平：《论明清之际“由数达理”的思维方法》，《哲学研究》1989年第7期。

陈增辉：《对方以智“合二而一”论的再评价》，《光明日报》1979年6月10日。

方晓珍：《方以智对儒释道三教之批评与会通思想论析》，《江淮论坛》2013年第3期。

高中庆：《〈东西均〉始探——与马数鸣同志商榷》，《江淮论坛》1983年第1期。

侯外庐：《方以智——中国的百科全书派大哲学家》，《历史研究》1957年6/7期。

姜国柱：《读〈东西均〉札记》，《社会科学辑刊》1979年第3期。

姜国柱：《略论中国哲学史上关于“一”与“二”、“分”与“合”的衍变》，《辽宁大学学报（哲社）》，1980年第1期。

蒋国保：《方以智的“合二而一”新论》，《哲学研究》1983年第10期。

蒋国保：《对〈方以智科学哲学思想初探〉的质疑》，《哲学研究》1985年第2期。

金隆德：《方以智“合二而一”论评议》，《江淮论坛》1979年第2期。

金隆德：《略论方以智的唯物主义认识论》，《群众论丛》1980年第4期。

金隆德：《试论〈东西均〉的矛盾学说》，《中国哲学史论》，太原：山西人民出版社，1981。

郭金彬、黄长平：《论“寓通几于质测”——方以智的科学思想》，《贵州社会科学》2010年第1期。

李慎仪：《〈东西均〉中“合二而一”的愿意和实质》，《哲学研究》1965年第3期。

刘文英：《方以智的“脑髓说”及其历史价值》，《中国哲学史研究》1987年第3期。

罗炽：《方以智易学方法论评析》，《湖北大学学报（哲社）》1989年第2期。

罗炽：《方以智的道家观》，《湖北大学学报（哲社）》1991年第6期。

冒怀辛：《方以智的哲学思想探讨》，《江淮论坛》1979年第2期。

冒怀辛：《方以智死难事迹续考》，《江淮论坛》1981年第3期。

冒怀辛：《方以智》，《中国古代著名哲学家评传·宋元明清部分》，济南：齐鲁书社，1981。

冒怀辛：《论方以智哲学思想的科学基础》，《哲学研究》1985年第10期。

冒怀辛：《方以智、易堂九子与理学》，《中国史研究》1987年第4期。

梅焕庭：《〈东西均〉辩证法思想剖析》，《中山大学学报（哲社）》1988年第3期。

马数鸣：《试谈方以智的“公因反因”说》，《江淮学刊》1962年第2期。

马数鸣：《方以智哲学思想的再探讨》，《江淮论坛》1980年第2期。

马数鸣：《从程朱到老佛——论方以智哲学的唯心主义和形而上学特征》，《江淮论坛》1985年第1期。

彭战果：《〈易余〉与方以智的易学观》，《周易研究》2011年第4期。

潘富恩等：《论方以智的朴素辩证法宇宙观》，《学术月刊》1979年第5期。

潘志锋：《方以智“三教合一”的超越性道统观》，《河北学刊》2011年第6期。

任道斌：《关于方以智的晚年活动——美国余英时教授〈方以智晚节考〉、〈新证〉、〈新考〉读后》，《清史论丛》第3期，中华书局，1982。

任道斌：《方以智简论》，《清史论丛》第4期，中华书局，1982。

宋豪飞：《方以智逃禅之实情及其心态探微》，《船山学刊》2012年第2期。

唐明邦：《科学家方以智的自然哲学》，《武汉大学学报（社）》1987年第5期。

陶清：《试论方以智哲学的最高范畴》，《江淮论坛》1987年第5期。

唐艳秋、彭战果：《一二之辩与方以智三教合一思想》，山东大学学报（哲学社会科学版）2009年第1期。

王煜：《读方以智〈东西均〉》，《明清思想家论集》，台北：聊经出版事业公司，1981。

吴根友：《试论〈东西均〉一书“三教归儒”思想》，《哲学分析》2011年第1期。

谢仁真：《方以智由儒入佛之检视》，载《第二次儒佛会通学术研讨会论文集》，华梵大学哲学系发行，1997。

邢益海：《道盛与方以智师徒的“托孤”说》，《贵州社会科学》2012年第7期。

邢益海：《方以智研究进路及文献整理现状》，《现代哲学》2013年第1期。

仪贞、冒怀辛：《方以智死难事迹考》，《江淮学刊》1962年第2期。

杨向奎、冒怀辛：《关于方以智和中国传统哲学思想的讨论》，《历史研究》1985年第1期。

颜泽贤：《方以智科学哲学思想初探》，《哲学研究》1984年第8期。

张岱年：《方以智哲学思想简析》，《天津师专学报》1980年第2期。

张岱年、陈来：《关于方以智的本体论与方法论》，《江淮论坛》1984年第2期。

张德钧：《方以智〈物理小识〉的哲学思想》，《哲学研究》1962年第3期。

张永堂：《方以智与王夫之》，载《书目季刊》第七卷第二期，1972年冬季号。

张永义：《由〈药地炮庄〉看方以智的惠施论》，《中国哲学史》2011年第4期。

张永义：《从〈仁树楼别录〉看方以智的晚年思想》，《中国哲学史》2012年第2期。

张世亮：《方以智的“太极不落有无”说》，《河南科技大学学报》（社会科学版）2011年第3期。

张世亮：《方以智〈东西均·三征〉哲学思想研究——以“统泯随，交轮几”为切入点》，《甘肃理论学刊》2012年第1期。

郑万耕：《方氏易学的太极观》，《北京师范大学学报》1996年第2期。

周勤勤：《方以智集大成思想初探》，《中国科学学院研究生院学报》2002年第5期。

周勤勤：《从方以智哲学看中国哲学创新》，《哲学研究》2012年第10期。

周锋利：《青原学风与方以智晚年思想》，《安徽师范大学学报》2007年第5期。

（三）近期博士学位论文

周勤勤：《方以智“均的哲学”研究》，中国社会科学院研究生院2003年博士学位论文。

刘贻群：《方以智〈东西均〉思想研究》，武汉大学2006年博士学位论文。

周锋利：《方以智三教会通思想研究》，北京大学2008年博士学位论文。

彭战果：《方以智儒、佛、道三教会通思想研究》，山东大学2009年博士学位论文。

邢益海：《方以智的庄学研究——〈药地炮庄〉初探》，中山大学2010年博士学位论文。

三、相关著作

陈寅恪：《柳如是别传》，上海：上海古籍出版社，1980。

陈垣：《陈垣全集》，合肥：安徽大学出版社，2009。

陈祖武：《清初学术思辨录》，北京：中国社会科学出版社，1992。

陈俊民：《张载哲学思想及关学学派》，北京：人民出版社，1986。

陈来：《朱子哲学研究》，上海：华东师范大学出版社，2000。

陈来：《诠释与重建——王船山的哲学精神》，北京：北京大学出版社，2004。

陈来：《有无之境——王阳明哲学的精神》，北京：北京大学出版社，2006。

蔡仁厚：《王学流衍——江右王门思想研究》，北京：人民出版社，2006。

程曦：《明代儒佛融通思想研究》，合肥：合肥工业大学出版社，2008。

冯友兰：《中国哲学史新编》，北京：人民出版社，2003。

方立天：《佛教哲学》（增订本），北京：中国人民大学出版社，1991。

傅小凡：《晚明自我观研究》，成都：巴蜀书社出版，2001。

郭齐勇：《熊十力思想研究》，天津：天津人民出版社，1993。

郭齐勇：《梁漱溟哲学思想》，武汉：湖北人民出版社，1996。

郭齐勇编著：《中国哲学史》，北京：高等教育出版社，2006。

郭齐勇：《中国哲学智慧的探索》，北京：中华书局，2008。

郭齐勇：《中华人文精神的重建：以中国哲学为中心的思考》，北京：北京师范大学出版社，2011。

郭齐勇，郑文龙编：《杜维明文集》，武汉：武汉出版社，2002。

侯外庐主编：《中国思想通史》（第四卷下），北京：人民出版社，1960。

何冠彪：《生与死：明季士大夫的抉择》，台北：联经出版事业公司，1997。

嵇文甫：《晚明思想史论》，开封：河南大学出版社，2008。

江灿腾：《晚明佛教改革史》，桂林：广西师范大学出版社，2006。

梁启超：《清代学术概论》，上海：上海古籍出版社，1998。

梁启超：《中国近三百年学术史》，太原：山西古籍出版社，2001。

梁漱溟：《人心与人生》，上海：世纪出版集团，2005。

劳思光：《新编中国哲学史》，桂林：广西师范大学出版社，2005。

林国平：《林兆恩与三一教》，福州：福建人民出版社，1992。

李维武编：《徐复观文集》，武汉：湖北人民出版社，2002。

林聪舜：《明清之际儒家思想的变迁与发展》，台北：台湾学生书局，1990。

牟宗三：《心体与性体》（全三册），上海：上海古籍出版社，1999。

牟宗三：《从陆象山到刘蕺山》，上海：上海古籍出版社，2001。

牟宗三：《宋明儒学的问题与发展》，上海：华东师范大学，2004。

牟宗三：《中国哲学的特质》，上海：上海古籍出版社，2007。

牟宗三：《中国哲学十九讲》，上海：上海古籍出版社，1997。

牟宗三：《中西哲学之会通十四讲》，上海：上海古籍出版社，2008。

牟宗三：《生命的学问》，桂林：广西师范大学出版社，2005。

牟宗三：《政道与治道》，桂林：广西师范大学出版社，2006。

牟宗三：《才性与玄理》，桂林：广西师范大学出版社，2006。

牟宗三：《名家与荀子》，长春：吉林出版集团，2010。

牟宗三：《道德的理想主义》，长春：吉林出版集团，2010。

庞朴：《一分为三论》，上海：上海古籍出版社，2003。

彭国翔：《良知学的展开：王龙溪与中晚明的阳明学》，北京：生活·读书·新知三联书店，2005。

彭国翔：《儒家传统：宗教与人文主义之间》，北京：北京大学出版社，2007。

钱穆：《中国近三百年学术史》（全二册），北京：商务印书馆，1997。

钱穆：《朱子学提纲》，北京：生活·读书·新知三联书店，2005。

钱穆：《宋代理学三书随箚》，北京：生活·读书·新知三联书店，2006。

任继愈：《中国哲学史》，北京：人民出版社，1979。

圣严法师：《明末佛教研究》，北京：宗教文化出版社，2006。

唐君毅：《人文精神之重建》，桂林：广西师范大学出版社，2005。

韦政通：《中国思想史》，上海：上海书店出版社，2003。

吴根友：《中国现代价值的初生历程——从李贽到戴震》，武汉：武汉大学出版社，2004。

吴根友：《明清哲学与中国现代化哲学诸问题》，北京：中华书局，2008。

王汎森：《晚明清初思想十论》，上海：复旦大学出版社，2004。

王茂、蒋国保等：《清代哲学》，合肥：安徽人民出版社，1992。

汪学群：《清初易学》，北京：商务印书馆，2004。

文碧方：《关洛之间：以吕大临思想为中心》，北京：中华书局，2011。

熊十力：《熊十力全集》，武汉：湖北教育出版社，2001。

熊十力：《新唯识论》，北京：中华书局，1985。

徐复观：《中国思想史论集》，上海：上海书店出版社，2004。

萧萐父，许苏民：《明清启蒙学术流变》，沈阳：辽宁教育出版社，1995。

萧萐父、许苏民：《王夫之评传》（上下），南京：南京大学出版社，2011。

萧萐父、李锦全：《中国哲学史》（上），北京：人民出版社，1982。

萧萐父、李锦全：《中国哲学史》（下），北京：人民出版社，1983。

许苏民：《顾炎武评传》，南京：南京大学出版社，2006。

许苏民：《李贽评传》（上下），南京：南京大学出版社，2011。

许苏民等编：《明清思想文化变迁》，南京：南京大学出版社，2009。

谢国桢：《明清之际党社运动考》，北京：中华书局，1982。

谢国桢：《明末清初的学风》，上海：上海书店出版社，2004。

向世陵主编，王心竹著《理学与佛学》，长春：长春出版社，2011。

杨向奎：《清儒学案新编》，济南：齐鲁书社，1985。

印顺：《中国禅宗史》，北京：中华书局，2010。

余英时：《论戴震与章学诚：清代中期学术思想史研究》（增订本），北京：生活·读书·新知三联书店，2012。

杨国荣：《王学通论——从王阳明到熊十力》，上海：华东师范大学出版社，2003。

杨国荣：《杨国荣讲王阳明》，北京：北京大学出版社，2005。

张岱年：《求真集》，长沙：湖南人民出版社，1983。

张立文：《宋明理学研究》，北京：中国人民大学出版社，1985。

张立文：《中国哲学范畴发展史（天道篇）》，北京：中国人民大学出版社，1988。

张学智：《明代哲学史》，北京：北京大学出版社，2000。

朱伯崑：《易学哲学史》（1～4卷），北京：华夏出版社，1995。

朱贻庭：《中国传统伦理思想史》，上海：华东师范大学出版社，2003。

郑宗义：《明清儒学转型探析：从刘蕺山到戴东原》，香港：香港中文大学出版社，2009。

[德]马克斯·韦伯：《儒教与道教》，洪天富译，南京：江苏人民出版社，2005。

[德]马克斯·韦伯：《学术与政治》，冯克利译，北京：生活·读书·新知三联书店，2005。

[日]荒木见悟：《明末清初的思想与佛教》，廖肇亨译，上海：上海古籍出版社，2010。

[日]荒木见悟：《佛教与儒教》，杜勤、舒志田等译，郑州：郑州古籍出版社，2005。