辞去了弘农县尉，李商隐又入秘书省，虽然这次的官衔比县尉高不了多少，但到底回到了京城，如果稳扎稳打，再加上妻子娘家的助力，升迁也不是没有可能。

只是这个时候，噩耗传来，李商隐的老母亲去世了。按照惯例，他得离职回家守孝三年，这意味着年届而立的李商隐不得不放弃跻身权力阶层的最好机会。

这次变故对李商隐政治生涯的打击是致命的，他闲居在家的三年，是李德裕集团最辉煌的时期。错过了这个时期，随着不久之后唐武宗的驾崩，李党骤然失势，李商隐此时回朝，面对的就只有虎视眈眈将他视为敌人的牛党官员了。

这股朝堂上的党争暗流终究影响到了他的家庭。李商隐的岳父王茂元在代表政府讨伐刘稹叛乱时病故，失去顶梁柱的王家很快家道中落。作为女婿的李商隐日子越发难过了，为了养家糊口，他甚至不得不丢下脸面去求已经成为牛党党魁之一的令狐绹，请他看在往日的情分上给他一个官职。

他甚至专门前去拜访令狐绹，只是令狐绹不在，于是他在墙壁上题下一首诗：

不学汉臣栽苜蓿，空教楚客咏江蓠。

郎君官贵施行马，东阁无因再得窥。

这诗本意是在委婉地提醒令狐绹莫忘旧日友谊，没想到却让令狐绹大怒。他想铲除题诗的墙壁，但由于这首诗里出现了他父亲的名字（“楚”），按照当时的习俗，他无法毁掉诗作，就只好锁上门不看。

最终，令狐绹给了李商隐一个盩厔县尉的小职位。十年之前，李商隐仕途生涯的起点也正是一个县尉的小官，宦海沉浮多年，他依然在原地踏步。

他沉沦下僚，官不挂“朝籍”，辗转于幕府替人捉刀代笔，只能勉强糊口。好在，他的妻子王氏依然不离不弃地跟随在他的身边。虽然为了生计，李商隐不得不四处奔波，夫妻聚少离多，但他们二人的心却始终在一处，恩爱如初。

可是幸运之神似乎觉得已给了李商隐足够的天赋才华，就不需要再对他的人生负责，于是听凭这位诗人生活困苦，磨难重重。

宣宗大中五年（851年），妻子王氏病逝，李商隐在这世间的最后一抹温情也离他而去了。

收到噩耗时，他尚在汴徐幕府任职，急匆匆地赶回家，妻子已经逝去两日。他伤心不已，陆陆续续写下了无数的悼亡诗。

忆得前年春，未语含悲辛。

归来已不见，锦瑟长于人。

今日涧底松，明日山头檗。

愁到天地翻，相看不相识。