1935年10月，重庆行营建立后，老谋深算的蒋介石见时机成熟，中央势力在四川已站稳脚跟，便正式命令刘湘撤销其二十一军特务委员会及所属各县清共会。

至此，在四川横行了五年多的二十一军特务委员会，终于灰溜溜地退出了历史舞台。其反共职能由蒋记特务系统取代。

特委会撤销后，刘湘按原有安排，将已经在各种训练班受训毕业的特务送到各对口部门，其余特务亦分别转入地方部门：沈天泽等调四川省政府；曾学思等调各县政府；游洪钧等调四川剿匪总司令部情报处……

特委会撤销后，原隶属于特委会的重庆反省院转入重庆市政府系统，“七·七”事变后撤销。

抗日战争全面爆发后不久，1938年1月，刘湘在武汉病逝。他原打算进一步重用的这批特务，也就“树倒猢狲散”了。

在这些特务中，宋毓萍与贺蜀筠的下场是比较典型的。

特务委员会撤销后，前特委会主任、军法官李靖伯送了两枝连发手枪给宋毓萍作为纪念，以示其依依惜别之情。

随后，宋毓萍被委任为川康督办公署中校副专员，派到军法处参加肃反组工作。不久，他又先后被送到四川善后督办公署军官研究班、四川省政府禁烟督察人员训练班受训，毕业后被委任为达县禁烟事务所长兼禁烟分局督察长。因当地禁烟局人事纠纷，他未能接任，又返回重庆，请示总局改派为南川禁烟分局督察长，进行所谓“禁烟”工作。他是怎样禁烟的呢？请看他自己解放后的交代：

帮助刘湘军阀解送了不少的烟税款子与推销“官膏”的价款……我们分吞私土，我前后得了五百多元，两次解款到渝，用现款换本票去缴款，我又得了七百多元，将这一共所贪污的一千二百多元都交给了我父兄拿去做生意，结果还是折光了事。

宋毓萍还在烟土行入股分利，在乡镇督销烟土，将没收之大烟交他人变卖分赃……总之是以禁烟之名行卖烟之实。

重庆解放时，正在重庆卫戍总司令部总务处任副处长的宋毓萍，随杨森部逃跑，逃至三台，部队溃散，宋毓萍又只身逃到成都。

时已至此，他还自不量力，居然企图组织反革命游击活动，后因同伙翻车毙命，成都又迅速解放，游击之梦才算破灭。他又跑到乐山，购买了价值200万元的鸦片，从事转运贩卖毒品的勾当。

1950年11月，宋毓萍在走投无路的情况下，被迫向人民公安机关自首。鉴于其罪大恶极，川西公安厅呈报中共川西区委员会批准，于1951年7月将宋毓萍判处死刑。

至于贺蜀筠，其下场比宋毓萍更为狼狈。参谋团入川后，已经以黄埔同学关系参加了参谋团工作的周显则、薛彦夫等人联名向康泽控告“贺蜀筠大量迫害黄埔同学”。康泽既为笼络人心，也为打击刘湘地方势力，下令将贺蜀筠逮捕，关了两年。抗日战争结束后，贺蜀筠去看望周显则时，已是满面烟容，十分潦倒了。以后再也无人知道他的下落。