1)、平定“三藩”
“三藩”都是降清的明将﹐吴三桂封平西王,留镇云南;尚可喜封平南王,留镇广东;耿仲明及其子死后,其孙耿精忠袭靖南王爵,留镇福建。各拥重兵、势力坐大,严重威胁清王朝的统治。康熙十二年﹐康熙在户部尚书米思翰、兵部尚书明珠等的支持下,果断地下令撤藩,令“三藩”各率所部归辽东。十一月﹐吴三桂举兵反,主力出贵州,掠湖南,分兵攻四川﹑江西,不久,尚之信(可喜子)﹑耿精忠﹑广西将军孙延龄起兵响应。康熙毅然命将出师,进行征讨。在历时八年的平乱战争中,年轻的玄烨表现出卓越的政治军事才能。他利用政治分化和军事压力迫使尚﹑耿二藩脱离吴三桂,招降陕西从叛的王辅臣,同时迅速平定内蒙察哈尔右翼王子布尔尼叛乱和北京城内杨起隆反清起事以安定后方,从而使清军得以集中力量与吴三桂主力相持于湖南,二十年,“三藩”之乱平定。
2)、统一台湾
康熙起用原郑芝龙部将施琅为福建水师提督﹐准备进军台湾。康熙二十二年六月,施琅率领水师两万余人,大小战舰二百余只,一举攻占澎湖,台湾失去屏障,郑氏军事力量损失惨重﹐郑克(郑成功之孙﹐郑经之子)﹑刘国轩等向清军投降。康熙支持施琅在台湾设官兵镇守的建议。否定了臣僚中弃而不守的谬见,在台湾设置一府三县(台湾府及台湾﹑凤山﹑诸罗三县),隶福建省,并设总兵﹑副将率兵驻守台﹑澎,使台湾重新统一于中央政府的管辖之下。
3)、征噶尔丹,安定西北
康熙二十七年,噶尔丹引兵三万越杭爱山向喀尔喀蒙古土谢图汗部发动进攻﹐喀尔喀各部败溃,噶尔丹以追击为名,直抵距北京七百里的乌兰布通。康熙决计亲征噶尔丹,以“除恶务尽”。二十九年﹑三十五年﹑三十六年,三次亲征,三十六年噶尔丹败死。准噶尔对喀尔喀蒙古的侵扰被粉碎,喀尔喀各部得以返回原地。康熙为加强对外蒙古地区的管理﹐沿袭了太宗皇太极以来的盟旗制度。采取联姻﹑封爵﹑年班﹑围班等措施,以密切与蒙古领主贵族的关系;特别是尊重蒙古族信仰的喇嘛教,以笼络僧俗人等和广大牧民。康熙三十年﹐亲率八旗劲旅前往多伦诺尔草原与喀尔喀蒙古诸部举行多伦会盟,把对内蒙古的较严密的管理制度推及于喀尔喀各部,这对加强北部边防,发展和巩固统一的多民族国家,起了积极的作用。康熙也十分注意西藏﹑青海问题﹐他深知西藏为蒙古各部尊奉的黄教(见格鲁派)领袖地位的重要,对准噶尔﹑和硕特等部插手西藏而使其政治动**保持警惕。五十二年﹐他册封班禅呼图克图为班禅额尔德尼。五十七年,以皇十四子胤为抚远大将军,进藏击败入侵西藏的准噶尔部首领策妄阿拉布坦,使西藏暂时得到安定。
4)、抗击沙皇俄国的侵略
康熙二十四年至二十六年﹐组织了两次收复雅克萨之战。二十四年四月﹐命都统彭春﹑副都统郎坦﹑黑龙江将军萨布素等率领水陆军约三千人﹐自黑龙江城(今爱辉)出发﹐进围雅克萨﹐俄军统领托尔布津乞降﹐率部六百余人撤往尼布楚。清军平毁城堡后回师。不久﹐沙俄侵略军重占雅克萨﹐次年五月﹐康熙谕令萨布素等率部再次攻取雅克萨﹐鏖战四昼夜﹐击托尔布津﹐俄军困守孤城。在沙皇政府请求下﹐清军于二十六年夏撤围。此后﹐两国通过平等谈判﹐于二十八年七月二十八(1689年9月7日)正式签订了中俄《尼布楚条约》,从法律上确定了中俄东段边界。这是中国和西方国家签订的第一个条约。康熙命在黑龙江重要处所建城驻兵﹐设置驿站﹐制定巡边制度﹐有力地保障了东北边境的安宁。