在这之前，李文忠已经劝谏过两次了，一次是劝谏朱元璋不要发兵征讨日本，一次是劝谏朱元璋在处理重要政治事务时不要过于依赖宦官。朱元璋虽然未予理睬，但也没有动怒，或者虽已动怒，但没跟他计较。李文忠明白，如果再次冒犯这个心狠手辣、六亲不认的舅舅，事情就不会如此简单了，因为他要劝谏的，是朱元璋最反感的事情。

他也做了最坏的打算，怀揣连夜写好的奏章，临出门时嘱托夫人要教育好孩子，好好养育孩子长大成人，将来好为国效力。这分明是要永别的节奏，夫人顿时泪如雨下，抱着他号啕大哭，李文忠也潸然泪下。

上朝后，李文忠果断地递上奏章。朱元璋打开奏章开始阅读，当他读到“叛臣贼子，定诛无宥，惟锻炼攀诬，滥杀无辜，人不自安，伤国元气”，顿时勃然大怒，突然离开龙椅，几步蹿到李文忠面前，指着他怒斥：“小子胆大包天，一派胡言乱语。朕斩绝叛逆，与你何干？你小子既然不怕死，老子就成全你，看哪个还敢啰唆！”不由分说，喝令武士将李文忠押下监候。

朱元璋要杀李文忠的消息很快就传到了内宫，让马皇后大吃一惊。朱元璋回宫后，看到皇后两眼含泪，闷闷不乐，也是大吃一惊：亲爱的，你怎么啦？哪个吃了豹子胆，居然敢惹你不快？马皇后说：惹我不快的不是别人，正是你自己！你不是要杀文忠吗？怎么没动手？你没想想，你一家亲人几十口都见阎王爷去了，现在就剩了个文忠，你还要赶尽杀绝……

碍于皇后的面子，朱元璋虽然赦了李文忠死罪，但削了他的官职，幽闭在家。洪武十七年三月，李文忠病逝，终年四十六岁。

李文忠是头一年冬天得病的。朱元璋命淮安侯华中负责医治，却又怀疑华中下毒，降了他的爵位，把其家属逐出建昌卫。其他几个给李文忠治病的大夫就没这么幸运了，他们的老婆儿女都被斩了首。

朱元璋的嗜杀成性，由此可见一斑。