消息传到中央，万历竟然一改凡事不管的态度，对打这一仗十分重视，圣意坚决，万历要举全国之力尽快平了这撮反动武装。

最初领导镇压叛乱的是三边总督魏学曾，但这人在平叛之初表现并不突出，领导下的明军正如哱拜当初所见，涣散无能，哱拜一方蛮悍的叛乱队伍压根没把魏大人的平叛力量放在眼里，一时间哱拜军势如破竹，连下中卫、广武、玉泉等镇，势力越发强大。万历一看大西北打半天了，这打得什么破玩意儿啊，再照这个情形打下去，我屁股下面的龙椅就要换成牢底了。

屁股下面发凉的万历赶紧重新调兵遣将，四月，调原总兵李成梁之子李如松出任宁夏总兵，浙江道御史梅国桢为监军，调集辽东、大同、浙、苗等多路队伍，平叛队伍重振士气，认真作战。与此同时，那个一直师出无功的总督魏学曾则带着一支实在庸碌的军队久攻宁夏不成，绝望之际，他竟想到了“和平招安”的馊主意。正不遗余力注视战况、希望一举大振国威的万历听到魏学曾的战报犹如五雷轰顶，差一点气炸了肺，不久就把这不争气的家伙调了回来，直接扔进了牢房——让朕冒着坐牢底的风险陪着你在宁夏不干正事，那不如你先来尝尝牢底的滋味吧。

魏学曾下课，原甘肃巡抚叶梦熊接替重任，叶梦熊可是个狠角色，平生打仗最爱的方式就是大炮轰之，想他当年攻打灵州的时候，便是直接靠大炮猛攻，一时间让明军军威大振，名扬西北。这次正是叶梦熊接了魏学曾留下的烂摊子。叶大人上任并没有立刻急着找大炮，他首先是认真观察了一下，认为之前的失败之所以会发生，军纪不严是最首要的问题，纪律涣散，军心不齐，还有就是军饷供应依然不能保证，经验丰富的叶大人深知，行军打仗最重要的就是后勤补给，给将士们吃饱穿暖，才有足够的人愿意替你打仗。哱拜本就是因为这个反了的，我军要是再不吸取教训，士兵再被逼得向敌方倒戈，那就完蛋了。万历这时候倒是表现出了相当大的果断和支持，圣旨予叶梦熊“尚方剑”，准违令者就地问斩，并且亲督军饷，犒赏将士。同时，兵部尚书石星为前线献计一条，这条计策其实前面那个倒霉的魏学曾就想到过，一直准备付诸实践：因为哱拜所占的宁夏城地势较低，而附近又有黄河流经，如果可以引水而过，放水淹城，应该效果会不错。万历就捎话给叶梦熊，要是敌人太凶残，那我们就不承诺放弃“水淹七军”的策略。

叶梦熊得了圣旨谕令，估算了一下硬攻难度太大，便毫不含糊地选择了水淹七军的损招。之前哱拜攻城略地，叛军成绩斐然，让明军一方士气大减，叶梦熊急着放个大招，也是为了尽快提升明军方面的**。在叶梦熊的领导下，明军夜以继日筑堤引水，终于在最短的时间内占据主动权，一举开闸之际，只见黄河水裹挟着无数淤泥沉沙向叛军盘踞的城内涌去，直接给哱拜及其部下上演了一幕黄河浊流滚滚的实况报道。

君不见黄河之水天上来，奔流到宁夏城里不复回，面对城中汹涌的黄河水，哱拜一众非常紧张，但是紧张还没有让他们完全失去分寸，毕竟是一群见过真刀真枪的汉子，兵变的几位首领临危还是保持沉着地坚守。因为他们相信，吃水仗只是暂时的，后援军很快会到——哱拜已经联络好了来自套部蒙古的兄弟，他们一定会及时出现，前来援救。

然而，他想太多了。

宁夏总兵李如松早在黄河咆哮之前就到了城南，切断了哱拜老头的援军。先锋将麻贵等人也以迅雷不及掩耳之势捣毁了套部骑兵，把哱拜信心满满的最后王牌轰出了贺兰山。这样，只留下孤零零的哱拜跟拎着大刀的叶梦熊在宁夏城口深情对望。

胜负似乎已经明辨，但是哱拜依然坚持着最后的抵抗。他哱拜是谁，那是曾经威名赫赫、战功数不胜数的西北传奇啊，戎马一生却在最后晚节不保走上叛途，结果却还未走出宁夏就输给了一众他暗暗鄙视过的明军将领。这本身已经是一种奇耻大辱，如若在败军之后再选择投降，那简直是把鞑靼汉子最后的尊严按在地上摩擦，所以他决定，要战斗到最后一刻，就算叶梦熊的大刀逼到他的眼睛前面，也决不投降。

哱拜虽然一根傲骨铮铮，但叛军的其他成员可没有那么齐心了，尤其是主谋哱承恩和刘东旸，随着反叛事业越发不顺，他们之间的嫌隙也日益增大，这些叛乱的兵士，压根就是因为军饷不发的问题，激起蛮悍的鞑靼人血性的愤怒，大家一拍即合，越说越气，一个冲动就造反，本身也没有什么安排预谋，更别提科学的权力分工了，一把义气维持着，打到最后，义气用光了，最容易出现的就是分裂（参看太平天国运动，那场农民起义最后也是这样失败的）。在反叛军营内出现裂痕之际，明军一方的监军御史梅国桢梅大人抓住了机会，给哱拜集团玩了一出反间计。在最危难的时刻，梅国祯派人去那边传了些挑拨离间的话，说是某位将领想要背叛兄弟接受朝廷招安。加上叛军首领之间本身就已是互相不满，猜忌重重，哱拜军营内部发生了严重火并，刘东旸、哱承恩都认为对方要将自己作为筹码向明军投降，争吵很快上升为残杀，哱拜的义子哱云也搅入其中，叛军一片混乱，不久，明军借乱发起总攻，宁夏城下，哱拜在绝望中选择了自尽了断，一家其余也被处决，这场不大不小的叛变终于被明政府圆满平息。

万历二十年（公元1592年）十一月，叶梦熊率大明军凯旋归来，举国同庆的同时，朱氏集团的老账本上也悄悄减去了二百余万的存款。战争总是最烧钱的，而万历总裁并没有太心疼，他更享受这场炫耀国威后阔别已久的骄傲感觉，自张居正死后他终于干成了自己主导的一场大业，这位心机极深的皇帝似乎很在意武战之功，他对内懒得和朝堂上的文臣纠缠，却把才智都放在了对外的刀剑沙场上，关于这一时期明中央和军务的分析，以及万历出奇优异的表现，我们讲完三大征的故事再说。