陈清澜坚守朱子学而批判陆、王、佛、老。其批判论给予后世以很大的影响。

除了他的辩才之外，其影响力主要还表现在以下三个方面：第一，他提揭“养神一路”这四字，以为剔抉异端之真髓，并指出了以往异端之辨的不完备性；第二，对朱陆同异论进行了彻底辩难；第三，在阐释佛学为异端的论辩中，对其变迁之后所带给儒教的影响，以及对民族和国家之祸患的历史事实，进行了揭示。当然，历史上也曾有过类似的异端之辨，但是与清澜的异端之辨比较，都显得较为片面和零碎，而且还不彻底。而对于其作为论辩基础的朱子学，他的解释则是从朱子学与陆（王）学冰炭不容的立场出发并加以比较的，只是这样的解释方法是否真的窥得朱子学之全豹，倒是值得怀疑的。

为什么这么说呢？因为如果把朱子学与陆（王）学截然区别开来，并加以理论化的话，那就势必会流于朱子学内心深处的体验，而缺乏对陆（王）学相关方面的理解，从而使朱子学有了堕于平板乏味之嫌。而清澜的朱子学又是与激烈批判王学的清初学者张武承、吕晚村、陆稼书等的朱子学一脉相通的，即使说清澜是他们的先驱，也不为过。