明宪宗成化十七年（1481），三十六岁的王华考中状元。此前，王华从祁阳归乡之后，屡次参加乡试，但都名落孙山。成化十六年，王华参加浙江省乡试，考得第二名。翌年，参加殿试，考取头名。

礼部每隔三年会在京城举行由各省举人参加的官吏选拔考试，合格者才有资格参加皇帝主持的殿试。殿试中合格的举人被称为进士。王华在殿试中取得头名，高登状元榜。考中进士是一族的荣耀，考中状元更甚。一旦成为进士或状元，就可以保证整个家族的荣华。

考取当年，王华就被授以翰林院修撰。成化二十年，王华又被授予殿试弥封官（弥封官是负责将参加殿试的考生试卷上的姓名部分用纸糊上，并写上编号的官员）。成化二十三年，王华出任会试主考官。所谓会试，是指将各省举人汇集到京城进行的中央考试。在会试中合格的考生，被称为“贡士”。明孝宗弘治元年（1488），王华参与编写《宪宗实录》，出任经筵讲官，负责给皇帝讲读经书。

弘治二年，本应加官晋爵之际，王华忽闻父亲竹轩公病倒的消息，便立即请求辞官，希望回家照顾父亲。朝廷和身边好友都劝他不要辞官，王华说：“亲有疾，已不能匍匐归侍汤药，又逐逐奔走为迁官之图，须家信至，幸而无恙，出岂晚乎？”

弘治三年，王华接到父亲去世的消息后即日南归，将父亲安葬在穴湖山，还在墓地旁边搭建起一间草屋为父亲守墓。据说，该墓地原是一处虎穴，老虎经常结队前来，但从不伤害王华。时间一长，老虎和王华也熟悉了，经常在小屋旁睡觉。人兽互不相犯，众人都认为这是老虎受王华感化的缘故。

弘治六年，王华为父亲守丧期满，重新出仕为官，升任右春坊右谕德，后来又被任命为经筵讲官。在此期间，他向明孝宗进献《劝学疏》。王华在其中写道：“今每岁经筵不过三四御，而日讲之设，或间旬月而始一二行，则缉熙之功，无亦有间欤？虽圣德天健，自能乾乾不息。而宋儒程颐所谓涵养本原，熏陶德性者，必接贤士大夫之时多，而后可免于一曝十寒之患也。”孝宗对此大加赞赏，欣然接纳。

弘治九年三月，王华被皇帝任命为每日进讲的日讲官。王华进讲时，声音洪朗，言辞贴切。他每日讲授圣人之学，规劝皇帝勤奋学习，远离逸乐，亲贤远佞。当时负责向皇帝进讲的还有数人，有些人在进讲之前会准备良久，但见到皇帝之后，还是会紧张失色，而王华则不做丝毫准备，进讲时却能雄辩异常，滔滔不绝。

一天，皇帝端坐御座，听日讲官进讲，当值的日讲官突然晕倒，意识全无，众人狼狈不堪，忙推荐王华代讲。王华从容来到书桌前，打开书本，整理了一下仪容，开始进讲，博得同行们的一片叹服。

当时宦官李广得宠。有一次，王华进讲《大学衍义》，其中有一段讲的是唐朝李辅国受唐肃宗宠信，坏事做尽，还勾结张皇后，祸乱朝政的事。当讲到这一段时，周围的侍臣都竭力阻止他，以免触怒李广，但王华毫不理会，他字正腔圆地大声诵讲这一段，毫无停止之意，身边的大臣都缩头吐舌，惊恐不已，而明孝宗却听得津津有味。进讲完毕后，明孝宗还特意赐给王华美食。

弘治九年四月，受诸位公卿推荐，王华升任东宫辅导。弘治十一年三月，他兼任东宫讲读，并且还出任顺天府的乡试官。弘治十四年，他又出任应天府的乡试官。弘治十五年，他担任翰林院学士，负责为皇帝拟定诏书。翰林院学士其实是一个名誉官职，只有优秀的学者才能获得这一职位。王华还受命指导鲁铎等庶吉士的学业（庶吉士是指从进士中挑选出来的，在翰林院任职的人员）。此外，他还受命参与编写《大明会典》，并于弘治十六年完成。

弘治十六年，王华出任詹事府的少詹事兼翰林院学士，负责东宫内外的日常事务。同年五月，他参与编纂《历代通鉴纂要》。六月，又升任礼部右侍郎，兼日讲官。王华的进讲主旨鲜明，内容丰富，深受明孝宗的喜欢，所以他才能长期担任主讲官之职。

弘治十八年，他奉命祭祀江淮诸神，途中顺便回家省亲。还朝后，他以母亲岑氏年老为由，数次提出还乡意愿，但都没有被准允，后来还被升任为礼部左侍郎。

弘治十八年夏天，明孝宗驾崩，明朝第十一位皇帝明武宗继位，翌年，改年号为正德。当时，宦官刘瑾专权，只要有人冒犯了他，就会立刻被投入监牢，真可谓刘瑾的一呼一吸都事关他人的祸福。很多士大夫都投奔其门，以求免祸自保。但王华并没有这样做，这让刘瑾耿耿于怀。

当时，王华之子王阳明是兵部主事，因为上书为狱中之人求情，触怒了刘瑾，被贬谪到贵州龙场。当刘瑾还是卑贱之身时，曾跟随王华的一位同乡学习书史，从那人处听说了王华的忠孝仁义，所以一直以来都非常仰慕王华。后来刘瑾获悉王阳明是王华的儿子之后，对王阳明的怒气也缓和了一些。刘瑾派人告诉王华：“吾于先生有旧，若一见可立跻相位。”

王华断然拒绝，这更加激怒了刘瑾。正德二年（1507），王华升任南京礼部尚书，刘瑾又派人前来道贺，并说：“不久将大召。”却仍被王华拒绝。刘瑾怒不可遏，但他费尽心机也找不出治王华罪的理由，后来翻出一件王华任职礼部时的陈年旧事，虽然与王华毫不相干，还是找了个莫须有的罪名，逼迫王华辞职。王华却非常高兴，说：“吾自此可免于祸矣。”