万幸的是，这道密旨走漏了风声，骆秉章、胡林翼、曾国藩等人一面上书力保左宗棠，又一面派人火速入京，寻求在朝为官的郭嵩焘的帮忙。
郭嵩焘此时在翰林院任职，闻知消息，马上找到了肃顺。肃顺本是清朝皇族，但却很有远见，常常说：“咱们旗人混蛋多，懂得什么？”可见这个肃顺对汉人还是很尊重的，也愿意起用汉人当中的有识之士。当下肃顺就告诉郭嵩焘，让他请人给天子写奏折，自己再趁机作保。郭嵩焘与肃顺的家庭教师王脬运商议之后，决定请与翁同齐名的潘祖荫执笔，上疏求情。
潘祖荫是探花出身，才华横溢，且世代在朝为官，祖父潘世恩官拜太傅，父亲潘曾绶官至内阁侍读，潘祖荫当年的举人身份都是其祖父八十大寿，道光帝一高兴给赏的，由此可见潘家很受皇帝信任。
事实证明，郭嵩焘这次还真是找对了人。潘祖荫给皇帝写的这封奏折，不但保住了左宗棠，还让左氏的名气在朝中传开，而他自己也因为这道奏折名扬天下，**一时。
潘祖荫在奏折中说，湖南之所以在平乱方面做得很好，还驰援四方，是因为当局领导调度有方，而骆秉章之所以调度有方，实际上是左宗棠在一旁出谋划策，这点天下人都是了解的。只是左宗棠为人疾恶如仇，又憨直自负，因此就有些宵小之徒，恶语中伤，总督官文也被流言蒙蔽，才上疏参他。左宗棠实在是国家才子，弃之可惜。
整篇奏折言辞恳切，咸丰读了之后不禁有点心动了，尤其其中一句“中国不可一日无湖南，而湖南不可一日无左宗棠”，让他越发觉得该留下左宗棠。这个时候，胡林翼上折保奏，称左宗棠“精熟方舆，晓畅兵略”、“名满天下，谤亦随之”。曾国藩也上折称左宗棠善晓兵机，才华远胜自己，恳请皇帝加授左氏巡抚之职，让他掌管湘湖局面，这样才能早一天**平太平军。肃顺也趁机向皇帝进言，说左宗棠“人才难得，自当爱惜”。加上骆秉章连连上折，一面为左宗棠表功，一面弹劾樊燮，为左宗棠辩护。这样一来，主告官文也开始动摇了，他不想因此得罪了整个湘湖的官僚势力，于是上折撤销了左宗棠的案子。
看到诸多高官为一个湘府幕宾争相保奏，咸丰也坐不住了，他早先也多少见到过一些给左宗棠请功的奏折，只是没想到此人能力这么大，于是咸丰皇帝觉得有必要对左宗棠进行一点深入了解。故此他专门召见了郭嵩焘，详细询问了左宗棠的才学人品，以及对朝廷的忠诚度等。
咸丰说：“这左宗棠似乎不大热心为朝廷办事啊。”郭嵩焘赶紧说：“哪里哪里，左宗棠这个人，性情刚烈，与世人不合。就算在湖南，也只是和骆秉章大人性情相投，所以不是他不热心，实在是个人秉性使然啊。”咸丰帝又问：“那左宗棠才华如何？”郭嵩焘赶紧回答说：“才华极大，还没碰到他解决不了的事，比才华更要紧的是，这人人品更为出色。”两人又说到了左宗棠的年龄，咸丰觉得左宗棠年龄也不小了，就让郭嵩焘劝左宗棠“莫自己糟蹋”。
再说左宗棠被参了一本之后，心中愤愤不平，坚持向骆秉章辞行，要去参加当年的会试。以当时左宗棠的情况，他要进京，弄不好就会把命给丢了，众人苦苦相劝，但左宗棠倔牛脾气一发，谁也挡不住，只能任由他离开长沙。回到老家后，左宗棠拜祭过祖宗先人，便徘徊北上，行到襄阳的时候，老友王柏心亲书来劝，胡林翼又写信吩咐襄阳道员毛鸿宾拦下左宗棠，不要让他上京。左宗棠看到胡、王的书信之后，心里稍稍冷静了下来，暂时罢去了入京的念头，转而去了胡林翼的军营，在那里暂且住下。过了一段时间，左宗棠又去了曾国藩的湘军大营。见到左宗棠之后，曾国藩劝左宗棠招募乡勇，同力抗击太平军。这个时候，咸丰的圣旨下来了，皇帝认定左宗棠无罪，命他为“四品京堂候补”，并随同曾国藩处理军务。“京堂”是个衙门的长官，虽然只是候补，但也还是很有盼头的，而且左宗棠起先属于被密旨处死的犯人，赢得这样的一个结果算是不错了。也正是从这个时候起，左宗棠开始招募军队，自己带领，终于结束了自己多年的幕宾身份，真正地走上了第一线，成为了清朝后期的一大支柱。这一年是1859年，左宗棠已经年近半百了。
再回头看樊燮。左宗棠被封四品京堂候补的同时，樊燮被革职查办，永不录用。他只好携家带口，回到老家湖北恩施。在这里，他在正屋的侧面修了一间双层角楼，把左宗棠骂他的“王八蛋，滚出去”几个字刻写在一块木板上，放到祖宗牌位旁边，称为“洗辱牌”。他还花重金聘请先生，把两个儿子关到角楼里去，要他们发奋读书。有意思的是，他还给儿子们穿上女人衣服，立下规矩：中秀才，可以脱掉女装外衣；中举人，脱掉女装内衣；中进士，焚洗辱牌，并告慰祖宗先灵。直到抗战初期，史学家刘禹生到樊燮故里，还可以清楚地看到，在樊家壁楼上，分明写着“左宗棠可杀”五个字。
也难怪樊燮要如此愤恨，当时左宗棠只不过是一个师爷，比他这个武人多读了一点书，就对他“肆加侮辱”，而且左宗棠的学问，在樊燮眼里看起来也不过是个“举人”，所以堂堂总兵大人，受一个举人的气，实在让樊燮颜面无存。他的儿子也还果然争气，大儿子不幸早逝，二儿子樊增祥就发奋苦读，一路考秀才，得举人，中进士，点翰林，入张之洞幕下办事，最后官至权署两江总督，晚年的时候，还给大名鼎鼎的梅兰芳做过文词老师，帮他修曲填词。
总之，左宗棠不似曾国藩那般谨小慎微，而其自负、憨直的性格也是他真正从晚清诸多能人志士中脱颖而出的推动因素，如果不是惹急了樊燮，樊燮也不会到皇帝那里告他一状，樊燮不告他，咸丰也就不会知道湖南还有一个“一印两用”的左师爷，也就不会听众人的劝谏擢用左宗棠，那么左宗棠或许还在安稳地当他的幕宾，就不会一夜间闻名天下，迅速上位。但是，到了后来，左宗棠也正是因为自己口无遮拦，开罪了慈禧，被撵出了京城，这是后话。