张居正去世六十二年后，明朝被旗人终止了。而张居正最初执政的时候，全国的土地有七亿亩之多，而当时明朝的人口就有六千多万，但到了张居正执政的后期，土地减少人口下降，并且国家的经济收入也受到了不小的影响。

张居正去世之后，万历皇帝把从张居正府中搜刮来的珠宝全部挥霍干净，然后在国库空虚的情况下，万历皇帝派了一批宦官充当矿监、税使，并且将工商税强行提高了很多，致使民间百姓怨声载道。

万历二十五年（1597年），朝廷所收上来的赋税比之前增加了八万多两，竟然比万历初年提高了百分之二十五的赋税率。而万历皇帝的这种做法是绝对错误的——整个明朝的商业都遭到了严重的摧残。行商的不敢再贩运，而坐商的也接连倒闭。

万历初年（1573年）的时候，河西务仅布店就有一百六十家，而到了万历三十年（1602年），其中的一百三十多家无法继续经营而倒闭了；原来临清的三十二家店铺中的二十一家店也倒闭了。

因此，整个明朝的商业税收总额就大幅度地减少了。到万历二十五年（1597年），整个明朝全部所能征收的关税下降了三分之一，这些都是由于朝廷的腐败造成的。张居正去世以后，整个明朝官场的风气明显开始发生变化。而万历皇帝终日只知道享乐，无心治国。由于万历皇帝不再批复奏折，所以开始出现了官员缺少的现象。京城以及南京科道方面的官员大量减少。而朝廷之中也减少了一半的官员。

明朝开始陷入经济和政治的大萧条状态，而张居正在世时的中兴景象也彻底消失。在万历末年（1620年），非常多的人开始记起张居正的好；万历三十八年（1610年），一位叫高以俭的文人为张居正制作了一本文集，在文集中大肆称赞他的功绩，并且朝廷内外开始出现为张居正喊冤的声音。

熹宗朝，张居正被平反了，曾经坚决反对张居正“夺情”的邹元标也公开称赞张居正为明朝作了非常多的贡献。在天启二年（1622年），身为左都御史的邹元标向熹宗上疏，提出为张居正恢复生前官衔的建议，并且把曾经属于张府的那些田地，还有没有变卖的房产一并还给张家。

崇祯三年（1630年），礼部侍郎罗喻义等人为张居正喊冤，随后，崇祯皇帝便恢复了张居正当初的官衔和称号。在崇祯十三年（1640年），张敬修的孙子张同敞提出恢复张敬修礼部主事职位的建议。而此时的明朝已经是摇摇欲坠了，而正是在这种情况下，人们又开始想念张居正所执政的时代了。

张居正在明朝历代的宰相中是最有政治眼光和魄力的一位，因此，他的影响才能如此深远。