郑成功之前在广东占据了潮阳，现在又有了厦门、金门为根据地，对巩固自己的实力终于有了后备保障。这年的十一月，由于清兵攻下了广州，情势非常危急，因此永历帝十万火急地派人去见郑成功，希望他能马上派兵支援。

郑成功心里非常清楚，如果他前去支援，不但潮阳方面守不住，就连刚刚获得的金门和厦门也非常危险。但是郑成功对明朝非常的忠心，永历帝有难，他无论如何都要去搭救。因此下先令弃守潮阳。一月间打下的潮阳，仅占领了十一个月，就宣告弃守。

当年的十二月，郑成功来到了揭阳，和叔父郑鸿逵商量这件事情。郑鸿逵十分赞赏他这种忠君的精神，并且预祝他能够顺利成功。

十二月二十日，郑成功起航南下，虽然揭阳的父老相亲希望他能够留在此地，可是郑成功一点都不敢怠慢，日夜兼程，希望早一日赶到永历帝的身边。

永历五年（1651年），郑成功的船队到达南澳。南澳守将陈豹对郑成功说：“现在广州方面的情势已经非常危险，这次赶到广州，恐怕连金门和厦门都要失手，倒不如就以南澳为指挥中心，两者兼顾，我陈豹愿意尽我所能，为大将军效命！”

郑成功知道他是一番好意，可是永历帝有难，他绝不能因为自己的根据地有失去的危险，就不前去相助，因此他对陈豹说：“我受先帝隆恩，已经决意要替国家效命。不管情况是多么危险，我也不会动摇，如金门和厦门真有变故，那只好等以后再说了。”

这时随行的施琅告诉郑成功，他昨天晚上做了一个很不吉祥的梦，这次南下勤王，可能会很不顺利。这种话在郑成功看来自然是非常的荒谬。他绝对不会因为施琅做了一个不祥之梦就改变了主意，不再南下。

在郑成功南下之时，郑成功的叔父郑鸿逵，派了他手下的两名大将萧拱辰和沈奇一起协助他。不料，二月二十五日那天，郑成功的船队在白沙湖的海面上遭遇了极大的风浪，船只几乎被倾翻。即使郑成功的手下都是老练的水手，可是遇上这么大的风浪，还是束手无策，最后船只很困难地驶向港湾，暂时等待大风过了再继续前进。

三月十日，郑成功的船队到了广州一个叫大星所的地方。船上的火夫到岸上去砍柴的时候被清兵驱逐。郑成功得知此消息后大怒，立即率领大军攻城，这一次非常顺利，不但一口气把城攻下，而且获得了许多粮食，这正是郑家军最需要的。

当大家都感到高兴的时候，忽然传来了不利的消息，原来厦门已经被清兵偷袭占领了。

得知厦门被清军夺去，郑成功的部下纷纷哀求他下令返回厦门。郑成功无法，只得率领军队返回。回到厦门的时候，清军不仅占领了厦门，还把郑成功的粮仓和所有的财产都劫掠一空。而他的部下也遭受了许多损失。

原来郑成功离开厦门南下勤王的时候，清政府的许多大官如巡抚张学圣、提督马得功以及大将王邦俊等，都想利用郑家军主力不在、厦门防备松散的机会攻取厦门。因此，他们就威胁郑成功的另一个叔叔郑芝豹用船带他们到厦门去。纵使郑芝豹一千万个不情愿，但是由于受到清兵的威胁也只得照办。

当初郑成功离开厦门时，曾把厦门的防卫工作都交给他的叔叔郑芝莞，并嘱咐他坚守厦门。

这时，在厦门的郑芝莞面对突然来袭的清军，吓得不知所措。他第一个想到的就是怎样保全自己的生命财产，至于郑成功临走时交代他的话，早已忘得一干二净。

清兵来到厦门后，提督马得功将郑成功的所有财物统统抢走。这些财物是从郑芝龙时候就留下来的，包括九十多万两黄金，无数的金银财宝，以及囤积的许多粮食。尤其是这些粮食，确实得来不易，那是郑成功发动了好几次战争才从沿海一带取得的。因此这一次的损失，对郑成功的打击实在太大了。当地老百姓和将士们的财产，也被清朝的官兵掠夺了不少，损失极为惨重。清军得逞后，却没打算留在厦门与赶回来的郑军主力决战，而是满载战利品马上回到内陆去了。

在广东的郑鸿逵听到了这个消息，马上赶回，准备在半途中拦住清兵，希望能够将财产夺回来。清军拿郑芝龙做挡箭牌，威胁郑鸿逵说，如果他敢反抗，他们回去就把郑芝龙杀掉。而且在安平他们还有郑家的家眷为质。接着，清军又劝诱说，如果放他们离开，一定保证郑家人的安全，这正是一举两得的事。郑鸿逵想了想，同意了清军的要求。

郑成功回来看到这种情形，无比的愤怒，下令攻打厦门，很快就把厦门重新占领了。

这次清军把郑成功多年来积蓄的粮食全部劫掠一空，使得郑成功不得不向沿海各地大肆征收粮食。他把征得的粮食以及一切物资都囤积在海澄。

郑成功回来之后，就追究厦门被清军偷袭的原因。他的叔叔郑鸿逵自认对这件事处理得不是很好，心中感到十分愧疚，打算从此退隐。将金门等地都交给郑成功管辖。

这次厦门虽然失守，但不久又再度收回。从此以后，士兵们个个都是敌忾同仇、斗志高昂，在此后的几次战役中，都取得了辉煌的战绩。之后，郑成功论功行赏并惩罚作战不力者，郑芝莞被斩，其他将领按功劳大小获赏、升擢不一。