任用军机大臣，摆脱了朝廷中各官僚机构的牵制，更重要的是，他发号施令可以直接下达到任何地方任何部门，从而把国家机要大权牢牢地控制在自己手里，他可以随意运用权力而不受阻滞。

雍正很快发现，管旗务的诸王因身份崇高，还影响皇帝对旗民直接统治的权力，于是他借整顿八旗，收回王公任用属人的权力，这又是他打击朋党的一个重要内容。

雍正继位之初，政权很不稳固，他在诸王大臣中的威信也不高，他必须树立自己的绝对权威。为此，雍正毫不手软地惩治了一切与朋党有牵连的王公大臣。