农村社区建设的指导思想是：以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，深入贯彻落实科学发展观，以党和政府为主导，以农民群众为主体，以建立新型的农村社区组织管理体制、服务体系与和谐文化为重点，坚持以人为本、因地制宜、资源整合、突出重点的原则，把农村社区建设成为管理有序、服务完善、文明祥和的社会生活共同体，推进城乡一体化建设、社会主义新农村建设和社会主义和谐社会建设。邓小平理论、“三个代表”重要思想和科学发展观，这三个既一脉相承又与时俱进的理论体系，是对马克思主义的继承和发展，是当代中国的马克思主义，是指导党和国家全局工作的理论基础。毫无疑问，也是农村社区建设的理论基础。只有毫不动摇地坚持这一理论基础，才能保证农村社区建设的正确方向。

农村社区建设的主导力量是党和政府。这就是说，党和政府是农村社区建设的组织者、领导者，农村社区建设是政府行为，而不是一般的社团组织或民间组织的行动；是事关国家稳定和发展的大事，而不是局部的无关紧要的小事。为什么农村社区建设必须由党和政府来主导？这是因为，党和国家的根本宗旨是全心全意为人民服务，党和政府是公共权力和公共资源的掌握者，党和政府在人民群众中享有的公信力、影响力、号召力、动员力、凝聚力是其他任何组织和个人不能比拟的。农村社区的基础设施建设也好，农村社区建设的各种资源整合也罢，都必须有一个有权威、有能力的主导者。这个主导者只能由党和政府来担当。

农村社区建设的主体力量是农民群众。这是因为：第一，农村社区建设的基本力量蕴藏于农民群众之中，农民群众的积极性是农村社区建设的内因，因而，农民群众是农村社区建设的主力军。第二，农民群众是农村社区建设的最终也是最大的受益者，农村社区怎么建设，建成什么样子，必须尊重他们的意愿。离开他们的现实需要，而主观地“想当然”，很可能要把好事办坏，出力不讨好。

建立健全新型的农村社区组织管理体制，建立健全完善的农村社区服务体系，构建和谐的农村社区文化，是农村社区建设的主要内容。也就是说，农村社区建设要创新体制机制，完善服务体系，发展和谐文化。

通过农村社区建设，推进城乡一体化、社会主义新农村建设和社会主义和谐社会建设。这一远期目标，表明了农村社区建设与消除城乡二元结构、新农村建设、和谐社会建设之间的关系，也表明了农村社区建设是实现城乡一体化、建设新农村与和谐社会的平台、措施、必要条件和有效途径。