天命十一年(1626),努尔哈赤宁远兵败，是他起兵至今受到的最大一次挫折，他为此心情沮丧，同时也为这时的国家大事担忧。《清太祖武皇帝实录》三月三日，记载他的引咎之言：

吾思虑之事甚多，意者朕心倦情而不留心于治道欤?国势安危房情甘苦而不省察欤?功勋正直之人有所颠倒欤?再虑吾子嗣中果有效吾尽心为国者否?大臣等果俱勤谨于政事否?

他在昼夜殚思，稽省治策的失措，后金的困难，诸申的烦苦，忠奸的倒衡，臣吏的怠绌，子嗣的继任等问题。努尔哈赤既在思索宁远之败的教训，又在筹虑身后军国的大计。但百思不得其解，陷于闷苦之中。

努尔哈赤为掩饰宁远兵败的郁闷，重振士气，把将士的不满引向蒙古，以其背弃“若征明与之同征，和则与之同和”的盟誓，兴师问罪。四月初四日，他率领诸贝勒大臣统兵西渡辽河。前锋军射死蒙古喀尔喀巴林部叶赫巴图幼子囊努克。努尔哈赤派大贝勒代善、二贝勒阿敏、三贝勒莽古尔泰、四贝勒皇太极以及济尔哈朗、阿济格、岳酰等统兵往西拉木伦河，获胜而归。五月二十一日，蒙古科尔沁奥巴贝勒来沈阳，他出城十里升帐迎接。但后金汗努尔哈赤这两次重大军政活动，《满文老档》缺载。看来，这时努尔哈赤或伤创未愈，或患病在身，抑或兼而有之。

劳师远袭和奥巴归顺，这都不能排解努尔哈赤因宁远兵败而潜郁在心灵深处的悲苦。久经疆场、攻无不克的后金汗，竟然会输给一名初历战阵、婴城孤守的袁崇焕?努尔哈赤思索、惭赧、痛苦、焦躁，食不甘味，寝不安眠，肝郁不舒，积愤成疾。努尔哈赤创伤未愈，痈疽突发，他于七月二十三日往清河汤泉沐养。八月初一日，派二贝勒阿敏杀牛烧纸，祈祷神佑，但毫无效果，病势危重，寻乘船顺太子河回沈阳。

1626年(天启六年，天命十一年)农历八月十一日，后金汗努尔哈赤在由清河返回途中，至离沈阳四十里的叆鸡堡死去。《清太祖高皇帝实录》记载：

(七月)癸巳(二十三日),上不豫，幸清河坐汤。八月庚子朔，丙午(初七日),上大渐，欲还京，乘舟顺太子河而下。使人召大妃来迎，入浑河。大妃至，溯流至叆鸡堡，距沈阳城四十里。庚戌(十一日),未刻，王崩。在位十一年，年六十有八。

大妃那拉氏见努尔哈赤死去悲恸欲绝，泣不成声。群臣抬着努尔哈赤灵柩至沈阳宫中。努尔哈赤的尸骨未寒，就发生汗位继嗣之争。

四大贝勒为代善、阿敏、莽古尔泰、皇太极，四小贝勒为阿济格、多尔衮、多铎、济尔哈朗。阿敏和济尔哈朗为舒尔哈齐子，属于旁支，不能争位。莽古尔泰性鲁钝，或言曾弑其母继妃富察氏，也不能争位。承嗣汗位鼎争者主要是皇太极、代善和那拉氏所出的多尔衮。大福晋那拉氏是努尔哈赤晚年的宠妃，为阿济格、多尔衮和多铎的生母。努尔哈赤死时，多尔衮十五岁，多铎十三岁，因受父汗偏爱，两人领有正白、镶白二旗，又有其三十七岁正当盛年的生母那拉氏控制于上，势力强大。这自为皇太极等人所难容。诸王以“遗言”为由，迫令那拉氏殉葬：

后饶丰姿，然心怀嫉妒。每致帝不悦，虽有机变，终为帝之明所制。留之恐后为国乱，预遗吉于诸王曰：“俟吾终，必令殉为之。”请王以帝遗言告后，后支吾不从。诸王曰：“先帝有命，虽欲不从，不可得也。”后遂服礼衣，尽以珠宝饰之，哀谓诸王曰：“吾自十二岁事先帝，丰在美食，已二十六年。吾不忍离，故相从于地下。吾二幼子多尔衮、多铎，当恩养之。”诸王泣而对曰：“二幼弟，晋等若不恩养，是忘父也。岂有不恩养之理!"于是，后于十二日，辛亥，辰时，自尽。寿三十七。乃与帝同柩。

就这样，大福晋那拉氏成为后金汗位争夺的牺牲品，同时殉葬的还有二庶妃阿济根和德因泽。

后来努尔哈赤的遗体葬于沈阳东石阻头山，是为福陵，又称东陵。

那拉氏死后，多尔衮与多铎年少，失去依恃，无力争夺汗位。汗位的争继主要在皇太极与代善二人之间角逐。代善虽为大贝勒，但性情“宽柔”,先已失宠，并被削夺一旗，无力与皇太极抗争。他在努尔哈赤生前，因恐皇太极图己，曾跪在其父面前泣诉。这说明代善在与皇太极争夺嗣位时已居下风。四贝勒皇太极兼领镶黄、正黄二旗，“奢得众心”,将卒精锐，“智勇俱全”,战功独多，又得到其兄正红旗旗主贝勒代善的支持，遂得继嗣父汗以登大位。但是，汗权的执行形式是四大贝勒共同听政。他们并坐议政，实行贵族共治，暂未形成君主专制。

后金汗努尔哈赤死后，辽东巡抚袁崇焕向明廷奏报。“奴酋耻宁远之败，遂蓄愠患疽死”。朝鲜《李朝仁祖实录》也作了记载，努尔哈赤于“七月间得肉毒病，林浴于辽东温井(泉),而病势渐重，回向沈阳之际，中路而毙，立其第四子(四贝勒)”。努尔哈赤之死与皇太极继立，对明朝和朝鲜的历史，后来均发生很大的影响。

努尔哈赤戎马佐您四十四年。现将他的家庭简况略述如下：

努尔哈赤有十六个妻子：

一、高皇后叶赫那拉氏，名孟古姐姐，为叶赫贝勒杨吉努女，比努尔哈赤小十六岁，是皇太极的生母。

二、元妃佟佳氏，名哈哈纳札青，生二子：褚英、代善；一女：东果格格。

三、大妃乌拉那拉氏，名阿巴亥，乌拉贝勒满泰女，比努尔哈赤小三十一岁，生三子：阿济格、多尔衮、多铎。

四、继妃富察氏，名衮代，生二子：莽古尔泰、德格类；一女：莽古济格格。

五、寿康太妃博尔济锦氏，蒙古科尔沁贝勒孔果尔女。六、侧妃伊尔根觉罗氏，生一子：阿巴泰；一女：嫩哲格格，又称沾河公主。

七、侧妃叶赫那拉氏，为高后那拉氏之妹，生一女：聪古图公主，即努尔哈赤之第八女。

八、侧妃博尔济锦氏，蒙古科尔沁贝勒明安女。九、侧妃哈达那拉氏，哈达贝勒扈尔干女。十、庶妃兆佳氏，生一子：阿拜。

十一、庶妃钮祜禄氏，生二子：汤古代、塔拜。

十二、庶妃嘉穆瑚觉罗氏，名真哥，生二子：巴布泰、巴布海；三女：穆库什及努尔哈赤之第五女、第六女。十三、庶妃西林觉罗氏，生一子：赖慕布。

十四、庶妃伊尔根觉罗氏，生一女，努尔哈赤之第七女。十五、庶妃阿济根，努尔哈赤死时从殉。十六、庶妃德因泽，努尔哈赤死时从殉。

努尔哈赤有十六子：长子褚英，又称褚燕，因赐号洪巴图鲁，也称红把兔。

次子代善，又称贵永介，因赐号古英巴图鲁，也称贵盈哥，或称大贝勒，后封礼亲王。

第三子阿拜。

第四子汤古代。

第五子莽古尔泰，又称三贝勒、掌正蓝旗贝勒。

第六子塔拜。

第七子阿巴泰。

第八子皇太极，又称红歹是、四贝勒，是为清太宗。

第九子巴布泰。

第十子德格类。

第十一章名汗归天

第十一子巴布海。

第十二子阿济格，后封英亲王。

第十三子赖慕布。

第十四子多尔衮，又称多儿哄，后封睿亲王。

第十五子多铎，又称多躲，后封豫亲王。

第十六子费扬古。

努尔哈赤有八女：

长女东果格格，又称东果公主，嫁何和里。

次女称嫩哲格格，又称沾河公主，嫁常书之子都统达尔汉。

第三女名莽古济，先嫁哈达贝勒孟格布禄之子吴尔古代，称哈达格格，又称哈达公主；后夫亡，改嫁蒙古敖汉部琐诺木杜棱。

第四女名穆库什，先嫁乌拉贝勒布占泰，后因有占泰欲射之以鸣镝，被努尔哈赤取回；又嫁额亦都第八子图尔格，称和硕格格，又称和硕公主。

第五女为穆库什同母妹，嫁额亦都之次于达启。

第六女为穆库什同母妹，嫁叶赫那拉氏苏鼐。

第七女其母为庶妃伊尔根觉罗氏，嫁那拉氏鄂托伊。

第八女称聪古图公主，嫁蒙古喀台喀台吉古尔布什。