噶尔丹回到漠北后，表面上向清王朝屈服，暗地里却继续招兵买马。他不但不去赴约和康熙签订盟约，还暗地里去漠南蒙古煽动叛乱，说自己向沙俄政府借了鸟枪兵六万，能够和清王朝决一死战。

康熙得知消息后，决定再次亲征噶尔丹。这次他兵分三路，东路由黑龙江将军萨布素带领，西路由大将军费扬古带领，中路则由康熙自己带领。

本来三路军是约好了夹攻噶尔丹，但是康熙帝的中路军却先和敌人的前锋队伍遇上了。随行大臣担心康熙有危险，就劝他班师回朝。康熙很生气：“我亲自出征，连噶尔丹都没见到就退兵，我如何向天下人交代。再说了，三路军约好了一起攻击，我要是先撤了，其他两路军怎么办？”

噶尔丹听说康熙亲征的消息后，吓得连忙拔营逃跑，最后在昭莫多被阻击了。

昭莫多是一片大树林，前面有一片开阔地带，向来是兵家必争之地。费扬古按照康熙的部署，先设下埋伏，然后派四百人假装和噶尔丹对战，一边打一边退，把敌人引入埋伏圈。然后双方展开了一番激战，最后，噶尔丹只带了几十名骑兵逃脱。

经过这两次大战，噶尔丹依然不肯向清王朝投降，准备继续顽抗到底。于是，康熙又再次带兵亲征。这次，噶尔丹的后院着火了。他的侄儿占领了他的根据地，他的左右亲信也纷纷投降清王朝。噶尔丹被逼得走投无路，只好服毒自杀。

从那以后，清政府重新控制了阿尔泰山以东的漠北蒙古，并赐给当地蒙古贵族各种封号和官职。清政府又在乌里雅苏台设立将军，统辖漠北蒙古。

从秦朝、汉朝的匈奴到明朝的蒙古，草原民族一直都是统治者们的难题。这个难题在康熙手上终于得到了解决，他对此曾说道：“以前秦朝大兴土木，修建长城抵御匈奴，现在我朝施恩喀尔喀，让他来防备北方，这比长城更为坚固。”

可见，在康熙看来，收服人心比单纯抵御更加有效，对于统治者也更加有利。

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福全和常宁是谁？

康熙第一次亲征噶尔丹，带了两个大将军，一个是抚远大将军福全，一个是安北大将军常宁。能够跟着康熙亲征的人肯定不是一般人，这两位大将军不是别人，正是康熙的亲兄弟。

福全是顺治帝的次子，母亲是董鄂氏宁悫(20)妃，被封为裕亲王。常宁是顺治帝的第五个儿子，母亲是庶妃陈氏，被封为和硕恭亲王。

康熙带着两位亲王亲征噶尔丹，可见康熙想要一举歼灭噶尔丹的决心有多强烈。