公元1226年，窝阔台在成吉思汗的授命下，指责西夏国主违约，再次率兵亲征西夏。

第二年六月，西夏国主李睍(20)遣使向成吉思汗投降。成吉思汗在击溃西夏军主力之后，随即将兵锋转向金国。他率军渡过黄河，经积石州攻入临洮路，接着又攻下京兆。同月，年迈多病的成吉思汗因积劳过度，在六盘山的营帐里离开人世。

成吉思汗临死前，再次把所有子女都召到身边，告诫他们一定要精诚团结，服从窝阔台的领导。

按照封建制度，帝王驾崩后应立即由他指定的继承人继位。但是，由于蒙古的库里勒台制仍起作用，窝阔台未能遵照父亲的遗命继承大位，在长达两年的时间里，大局一直被成吉思汗的嫡四子拖雷把持着。

公元1229年秋，蒙古宗王和重要大臣举行大会，推选新大汗。会上，有人恪守旧制，主张立窝阔台为汗；有的则反对成吉思汗的遗命。大会一直争执了四十余天，也没有得出结果。

这时，察合台全力支持窝阔台。而原本支持拖雷的术赤已于四年前去世，拖雷势孤，只得向窝阔台俯首称臣。窝阔台则遵照父亲的遗旨，采纳众弟兄的劝告，继承了汗位。