魏晋南北朝时期，治谱牒之学者颇有其人，上文所举傅昭、姚察是为名家。此外如：徐勉“该综百氏，皆为避讳”[1]。刘杳“博综群书”，深于谱学之史。史载：“王僧孺被敕撰谱，访杳血脉所因。杳云：‘桓谭《新论》云：太史《三代世表》，旁行邪上，并效周谱。以此而推，当起周代。’僧孺叹曰：‘可谓得所未闻。’”[2]又有陆琼“详练谱牒，雅鉴人伦”[3]，等等。北魏元晖业撰有《辩宗录》等书[4]，说明北朝的谱牒之学也很受重视。北齐魏收撰《魏书》，多采用谱牒之书，据以入史，酿成了《魏书》的风波，经久而不能平息[5]，是北朝重谱学而引发的一场闹剧。
从南朝谱学来看，贾氏谱学与王氏谱学最为知名，影响也更大。唐代谱学名家柳芳对此有所论述，他写道：
魏氏立九品，置中正，尊世胄，卑寒士，权归右姓已。其州大中正、主簿，郡中正、功曹，皆取著姓士族为之，以定门胄，品藻人物。晋、宋因之，始尚姓已。然其别贵贱，分士庶，不可易也。于时有司选举，必稽谱籍，而考其真伪。故官有世胄，谱有世官，贾氏、王氏谱学出焉。由是有谱局，令史职皆具。[6]
这一段话，把士族、谱籍、世胄、世官、谱学、谱局等之间的关系揭示得十分清晰。正是由于谱学在政治、思想和世风上具有如此重要地位，故唐初史家撰《隋书·经籍志二》乃以“谱系篇”为史部十三类之一。如前所述，其小序反复申言：“晋世，挚虞作《族姓昭穆记》十卷，齐、梁之间，其书转广。”又说：“其中国士人，则第其门阀，有四海大姓、郡姓、州姓、县姓。”可见，谱学的发展在东晋、南朝实为社会生活中的一件大事。萧子显《南齐书》记东晋、南朝贾弼之及其子、孙三世治谱学，以及萧齐王俭随之而起关注谱学事，他写道：“先是谱学未有名家，（贾）渊祖弼之广集百氏谱记，专心治业。晋太元中，朝廷给弼之令史书吏，撰定缮写，藏秘阁及左民曹。渊父及渊三世传学，凡十八州士族谱，合百帙七百余卷，该究精悉，当世莫比。（齐）永明中，卫军王俭抄次《百家谱》，与渊参怀撰定。”[7]《隋书·经籍志》史部“谱系篇”的著录，虽已见不到贾渊祖孙三代人致力于谱学的具体面貌，但萧齐王俭以下的谱学之书，仍可以反映出那时谱学发展的盛况。
贾氏谱学起于东晋太元（376—396年）中，当是对魏晋南北朝时期的谱牒之学起到了奠基的作用，而其数世相传，成为家学，故影响甚大。
王氏谱学较贾氏谱学晚出，但其影响颇有后来居上之势。王氏谱学兴起的原因，一是受到贾氏谱学的熏陶，二是南朝谱牒之书一度十分混乱，真伪杂陈，需要进行大规模清理。先是，贾氏谱学深受门阀士族喜爱，有的甚至熟读谱书，对门阀大姓的来龙去脉了如指掌。史载：南朝刘宋时，“太保王弘、领军将军刘湛并好其书。弘日对千客，不犯一人之讳。湛为选曹，始撰百家以助铨序，而伤于寡略”。王、刘二人可以说是深受贾氏谱学熏陶的代表性人物。南朝萧齐时，卫将军王俭因刘湛所撰《百家谱》过于简略，“复加去取，得繁省之衷”，撰《百家集谱》十卷。值得注意的是，“王俭抄次《百家谱》，与（贾）渊参怀撰定”[8]。由此可以看出王氏谱学与贾氏谱学的渊源关系。
王氏谱学的兴盛，是由王僧孺来完成的。这同南朝谱书发生混乱、真伪难稽有关。李延寿《南史·王僧孺传》记：
（王僧孺）转北中郎谘议参军，入直西省，知撰谱事。先是，尚书令沈约以为：“晋咸和初，苏峻作乱，文籍无遗。后起咸和二年以至于宋，所书并皆详实，并在下省左户曹前厢，谓之晋籍，有东西二库。此籍既并精详，实可宝惜，位宦高卑，皆可依案。宋元嘉二十七年，始以七条征发，既立此科，人奸互起，伪状巧籍，岁月滋广。以至于齐，患其不实，于是东堂校籍，置郎令史以掌之。竞行奸货，以新换故，昨日卑细，今日便成士流。凡此奸巧，并出愚下，不辨年号，不识官阶。或注隆安在元兴之后，或以义熙在宁康之前。此时无此府，此时无此国。元兴唯有三年，而猥称四、五，诏书甲子，不与长历相应。校籍诸郎亦所不觉，不才令史固有忘言。臣谓宋、齐二代，士庶不分，杂役减阙，职由于此。窃以晋籍所余，宜加宝爱。”武帝以是留意谱籍，州郡多离其罪，因诏僧孺改定《百家谱》。
这一记载表明，王僧孺受梁武帝之命撰写新谱，是由于梁武帝接受了沈约的建议，而沈约的建议则是由于谱牒之书混乱而引发的。沈约建议的基本出发点是“宋、齐二代，士庶不分，杂役减阙，职由于此”，主要是从等级社会的政治秩序着眼的。但从这份建议中，也可以看到当时人们的热衷于作伪和历史知识的贫乏，以致在作伪之中出现了许多可笑的错误，可谓道德与知识的双重悲哀。从这里，人们多少也可以窥见南朝时期的社会风貌。
王僧孺是当时的知名学者，史称：“僧孺好坟籍，聚书至万余卷，率多异本，与沈约、任昉家书埒。少笃志精力，于书无所不睹，其文丽逸，多用新事，人所未见者，时重其富博。”[9]上文讲到王僧孺“被敕撰谱”后，曾向刘杳请教谱学的渊源，并说“可谓得所未闻”，表明他是一个谦虚的学者。其后，王僧孺集《十八州谱》七百一十卷，撰《百家谱集抄》十五卷、《东南谱集抄》十卷[10]，形成了王氏谱学的新局面。