车臣地区的战事结束后，车臣武装分子的恐怖袭击活动还一直在进行着，而且都是拿“亲俄”的当地居民开刀，利用极为血腥和残酷的手段对付他们。

2002年11月10日，俄罗斯—欧盟峰会在布鲁塞尔正式举行，会上，西方记者很不礼貌地问到了“车臣反抗与人权”问题，普京强硬回击：“如果你想加入恐怖分子的团伙组织，那么我会请你来莫斯科做个简单的包皮手术，因为我们的专家十分擅长做这项工作，必然可以成功解决你所遇到的问题。”此后，“割包皮”成为普京强势反恐的经典代名词，也成为他对西方所作所为做出的激烈回音。

接连不断的恐怖袭击表明，尽管车臣境内的战事已经基本结束，但反恐斗争还将继续上演。

2002年12月27日，车臣武装分子制造的“人体炸弹”在格罗兹尼市政府大楼引爆，此次事件直接导致80余人殒命。

2003年3月1日，车臣组成的临时政府领导人卡德罗夫在前往政府办公的路上遭遇车臣武装分子的袭击，随行的护卫人员在战斗中死亡7人，车臣叛匪中也有1人丧生。

2003年4月17日，时任自由俄罗斯党主席的谢尔盖·尤申科夫在回家的途中遭到恐怖分子袭击，不幸遇难。这是近年来，第二位自由俄罗斯党的领袖人物遭到刺杀。2002年，该党的前任主席戈洛夫廖夫也在回家途中遇刺身亡。那天傍晚，尤申科夫完成自己的工作，乘车回家。但当他刚刚下车，正准备走入自己家中时，一名手持装有消音器手枪的恐怖分子突然出现，对着尤申科夫一阵乱射，在他倒地之后，恐怖分子弃枪逃跑。尤申科夫的司机在感觉到异常之后立即下车，却发现尤申科夫浑身鲜血，身上多处中弹。于是司机立即向最近的医院求救，但救护人员还没赶到，尤申科夫就已经因伤势过重，不治身亡了。

2003年5月9日，车臣政府正在筹备阅兵仪式，以此来庆祝车臣战争的胜利。但在举行阅兵仪式的体育馆附近发生了一起爆炸事件，有一名警察当场被炸死，两名俄罗斯士兵身受重伤，阅兵活动不得不被取消。

2003年5月12日，一处车臣地方政府的办公大楼发生爆炸事件，有52人当场死亡，300余人受伤。这天的上午10时左右，一辆满载炸药的卡车直接冲进了纳德捷列其内依地区的政府大院，车上两名自杀性的袭击者引爆了车上将近1.5吨的炸药，政府大楼直接被炸塌半边，外面的路面也被炸出一个直径超过15米、深度将近7米的大坑。

2003年5月14日，车臣地区的第二大城市古杰尔梅斯附近的一处村庄发生大爆炸，直接导致30余人死亡，150多人受伤。

5月14日下午，沙斯罕-尤尔特村举行了一场宗教活动。来自车臣地区的将近15万穆斯林民众聚集在一起做礼拜，车臣政府的一位领导人卡德罗夫也亲临现场。3时许，全体参会人员刚刚做完礼拜，突然在人群中响起了爆炸声，很多人应声倒下，现场一片混乱。爆炸声刚刚响起，卡德罗夫的警卫便直接将他扑倒在地上，最终卡德罗夫没有受到任何损伤，他的警卫却重伤不治，当场身亡。随后，在清理现场时，发现总共有4名警卫被炸死。

爆炸发生后，不到三个小时，警方便查明了这起事件的真实情况。引发这起爆炸的是一名中年妇女。她伪装成记者来到现场，并携带炸药混到离演讲台很近的地方，趁着大家不注意的时候，便直接引爆了身上的炸药，这名妇女在瞬间被炸成碎片，现场下起一阵血雨。

2003年6月5日，车臣地区的一处俄方空军基地，一名身上携带烈性炸药的年轻女子在途经一辆运送数十名俄方航空机械维修师的车辆时，瞬间扑向了汽车的车厢，并引爆了身上的炸药。这起爆炸事件导致俄方当场死亡15人，其余人也受到不同程度的伤害。

2003年7月5日，“羽翼”摇滚音乐节在莫斯科如期举行，当时现场聚集了将近3万名观众，但在音乐节进行到一半时，却在人群中间发生了大爆炸，导致17人死亡，将近40人受伤。

2004年2月6日，莫斯科的一处地铁站发生剧烈爆炸事件。这一天，恐怖分子携带将近5公斤的烈性炸药，在地铁启动之后随即引爆。虽然这些炸药总量并不算多，但地铁穿行的隧道是封闭的，这就导致爆炸的威力呈几何式增加，致使爆炸的余波波及到了距离爆炸中心很远的乘客，很多人并没有受到任何外伤却被活活震死。处于爆炸事发点的车厢直接被炸得四分五裂，残肢断体飞散在车厢内外，甚至飞溅到四周的隧道壁上。地铁隧道俨然一副人间地狱的惨相，隧道内浓烟滚滚，哭喊声不绝于耳。事后，据俄罗斯相关部门统计，共有40人丧生在此次爆炸事件中，并且还有100多人身受重伤，150多人受到轻伤。

2004年9月，一伙恐怖分子突然出现在北奥塞梯共和国的一所学校内。他们挟持了学校里的学生、老师以及所有的工作人员，并在学校的主体建筑内安装了定时炸弹。随后俄罗斯政府与恐怖分子进行了深入谈判，但最后未达成有效协议。于是，普京命令当地警方强行解救人质，不料，负隅顽抗的恐怖分子在走投无路之下直接引爆了炸弹，学校人员伤亡惨重。据统计，此次爆炸事件，导致331人死亡，包括180多名学生，受伤者更多，达到了500多人。

针对多起恐怖袭击事件，很多人认为，由于普京的强硬态度，才造成了一系列恐怖爆炸案的发生。在一次新闻发布会上，有记者问了这样一个问题：“俄罗斯政府考虑过与车臣叛匪进行谈判吗？”

普京有些气愤地反问道：“你们考虑过跟本·拉登谈判吗？你们怎么不将拉登请到白宫，坐下来好好谈谈，问清楚对方想要什么，然后满足他的要求，再护送他离开？”

普京接着说：“你们认为本·拉登是十恶不赦的魔鬼，不和对方做交易。那么俄罗斯为什么就要跟残害儿童的畜生谈判呢？任何人都没有资格站在道德的制高点说教我们，逼迫我们跟疯狂杀戮的恐怖分子谈判！”