是夜，正在启人他们熟睡之际，梅菲斯兽的追踪部队已经来到了。
亚路加兽和奇蛙兽突袭而来，犯下第一桩罪——
私闯民宅。
面对来势汹汹的两只完全体数码宝贝，阿海带着美波逃走。
启人跟基尔兽对上了亚路加兽。
最后，启人以一张【风速之翼】赋予基尔兽飞行能力，让它成就成长期击败完全体的壮举。
（对于此事，同样曾经跟亚路加兽交手过的祖顿兽表示不想被cue。）
至于奇蛙兽，再犯下不讲武德殴打高龄老人跟追杀幼女种种劣迹行为后，得到了制裁。
危急关头，美波笔记本电脑中的V-PET实体化了。
它就是大发神威的石狮子兽。
成熟期的它忠心护主，一出场就强势虐杀了完全体的奇蛙兽。
叫你欺负老人。
叫你欺负小孩。
石狮子兽下手一点都不轻。
可惜启人他们太大意，没发现追踪部队还剩一名蝠鲼兽。
潜藏在海中的敌人猛然突袭，一击得手，掳走了美波后快速远遁而去。
这种一击脱离战法（Hit and Away）本该是金刚兽的美学。
在这边的世界里，蝠鲼兽表示自己才是真正的行家。
与此同时，电脑里的V-PET不断蚕食各种数据，让系统失控。
它们开始露出了本来的恶魔面孔，对整个网络造成更加严重的影响。
上下水道局的电脑出现故障，排水系统崩溃，下水道里一时间涌入大量水。
早就感知到数码宝贝气息的妖狐兽与留姬主动现身引诱敌人出手。
天亮前的街道上空无一人。
他们就是最显眼的诱饵。
不，你们梅菲斯兽大人交给我的铲除对象！
水压把街上下水道盖子全部推上了半空，蓝火焰兽赫然现身在水流中，冷然一笑。
有所戒备的妖狐兽让驯兽师避开一些，然后主动冲上前去应敌。
蓝火焰兽手一挥，寒冷气息喷涌，妖狐兽的身躯上快速覆盖上一层坚冰。
“啊……”
一个照面妖狐兽就受了伤。
留姬十分担忧。
而健良那边，危机同样来临了。
打算提早结束行程回家的健良早早来到了码头，准备乘船去那霸市。
在码头等船的健良跟大耳兽眼看着船靠近，面露喜悦。
只是这份喜悦很快转为愕然。
他们眼睁睁看着船上冒出火焰，然后数度爆炸，而且继续开过来了。
急忙跑开的他们还是被爆炸风吹倒在地。
着火的船撞上码头发生剧烈爆炸。
硝烟之中，露出了造成事故的元凶，龙虾兽。
找到你们了，我的功绩！
龙虾兽兴奋地张开血盆大口，巨大虾钳重重挥下，船体残骸被砸飞。
眼看驯兽师陷入危险，大耳兽果断跳起，发动攻击。
对此不屑一顾的龙虾兽一钳把它打飞。
太弱了，成长期的小狗！
想要赢！
必须进化！
大耳兽跟妖狐兽心中有着同一个念头。
“大耳兽！”
“妖狐兽！”
两处战场，健良、留姬呼唤着搭档的名字。
感应到它们的危机，它们的决心，它们与驯兽师之间的羁绊，古乐兽头上印记发出红光，赐予两只数码宝贝进化的力量。
大耳兽进化，加鲁哥兽。
妖狐兽进化，九尾狐兽。
蜕变的身姿，凭身经百战得来的一身力量，开始反击。
鬼火玉！
达达上勾拳！
爆裂燃烧的狐火灭杀了残忍的蓝火焰兽。
漂亮的上勾拳打碎了龙虾兽的权力美梦。
拿下胜利后，留姬才发现许久不见的古乐兽。
它不是应该跟在基尔兽身边，在冲绳那边吗？
她可不知道古乐兽通过数码通道跑过来了。
就在此时，她听到了一道声音对她发出呼唤。
“留姬，九尾狐兽，我需要你们的力量。”
“健良，加鲁哥兽，我同样需要你们的力量。”
在神秘的光辉映照下，他们的身影消失在原地。
在数码通道，他们见到了呼唤他们竟是究极体的数码宝贝奥米加兽。
留姬终于明白，原来，那个人口中的那位大人就是奥米加兽。
难怪……
究极体，确实惹不起。
留姬可还没自大到认为单凭现在的自己跟妖狐兽能打败究极体。
她不动声色，不想泄露那对组合的事情。
奥米加兽也看破不点破，大家默契当做那段小插曲不曾发生过。
他们在奥米加兽的带领下，往幕后黑手梅菲斯兽所在的位置移动。
途中，奥米加兽将梅菲斯兽的存在告知了留姬他们。
顺便也秒杀了一堆拦路小怪，装甲体的古海龟兽，完全体的机械巨龙兽，一视同仁。
斩瓜切菜一般的容易，来一只送走一只。
来一堆，全归西，团团圆圆。
无奈是它的力量太强大，无法进入现实世界，不得不借助留姬他们的力量。
启人那边，准备出海营救被掳走的美波。
既然已经知晓一切都跟VP机械有关，而他们公司在这边就有一个基地，杀过去就完事！
阿海执意要一起跟过去。
他们闯入时遭遇蝠鲼兽与深海兽的埋伏。
仇人见面，分外眼红。
这回对上蝠鲼兽，基尔兽直接进化成了古拉兽，一招【等离子刃】解决了可耻的偷袭者。
至于石狮子兽，不必替它担心，深海兽在它面前只有挨打的份。
一路打倒基地的守卫，启人他们终于找到了美波。
可是上原美波的爸爸上原武人中了梅菲斯兽的陷阱，以为女儿跟社长都成了人质。
最后透露出了对付V-PET的疫苗其实就在美波的电脑里，就是她的电子宠物。
也就是说，已经实体化的石狮子兽。
梅菲斯兽得到了它所要的情报。
原来一切都只是它的阴谋。
它伪装成人类，以V-Pets机械会长玉城隆二的身份开始布局，利用该公司生产的V-Pets来传播病毒。
如今阴谋败露，它撕掉了伪装，恢复成原有的姿态。
看着人类在自己的面前变成了羊首恶魔，启人他们颇为震惊。
基尔兽奋力与之一战，可是根本不是对手，轻易就被梅菲斯兽打倒。
奥米加兽及时赶到，把健良、留姬、九尾狐兽、加鲁哥兽送到了战场，给启人与古拉兽助威。
梅菲斯兽以一敌三，丝毫不惧，一个大招把所有人打进了它所创造的特殊数码空间之内。