东亚模式取得了令人瞩目的经济发展成就，但这种模式的弊端也是显而易见的，这主要表现在以下三方面：

一是经济快速发展必然导致“萝卜（卖得）快了不洗泥”。意思是说，发展速度太快了经济质量就容易下降，以至于形成泡沫经济。

二是东亚模式过于依赖外部市场和国际资本。不用说，你的经济发展快了、别国经济相对慢了，就容易引起国与国之间的经济和政治冲突，从而带来不良影响，这也是1998年爆发亚洲金融危机的根源之一。

三是东亚模式容易在国内造成经济不平衡，从而带来经济衰退。一方面是，政府主导型市场经济容易阻碍市场机制充分发挥作用，扭曲市场；另一方面是，过于偏重外向型经济、对国际市场依赖性太强，国外经济的泡沫破灭时就会出现所谓外需不足导致的国内经济衰退；与此同时，雁行经济形态本身也会加剧区域经济发展的不平衡。为此，韩国就推出了一种新的发展模式即国家均衡发展战略，并且成立国家均衡发展委员会来主抓这件事，以遏止贫富差距扩大、产业竞争力下降等问题。