庾亮抵达寻阳（今江西九江市西）后声称接到庾太后命令，任命温峤为骠骑将军、开府仪同三司，郗鉴为司空。温峤对庾亮有点小崇拜，这个时候不但不背弃他，还分出一部分士兵给庾亮。

面对当前的形势，温峤认为没有陶侃的帮助，就不可能战胜苏峻。在他的建议下，庾亮同意推举征西大将军、荆州刺史陶侃为盟主，联兵讨伐苏峻。陶侃对自己没有被列为托孤大臣的事情耿耿于怀，对庾亮很有成见，起初不答应，后来庾亮专门写信向陶侃道歉，加之陶侃也怕苏峻得势后自己没有立足之地，终于还是答应了。他穿上铠甲，登上战船，星夜兼程而来。

咸和三年（328）五月，陶侃率领大队人马到达寻阳，庾亮又当面向陶侃道了歉，陶侃摒弃前嫌，跟庾亮和好如初。陶侃作为盟主，率领六万将士浩浩****出发，旌旗延绵七百多里。

苏峻听说陶侃等人发兵来征讨，赶紧从姑苏回兵石头城，并把司马衍等人强行带到石头城。

陶侃上表推荐王舒监浙东军事，虞潭监浙西军事，郗鉴都督扬州八郡军事，并命令王舒、虞潭服从郗鉴的调度。郗鉴率将士渡江南下，与陶侃等在茄子浦会合。雍州刺史魏该也率兵来助。五月二十九日，勤王军向石头城进发。

宣城（今安徽宣城市）内史桓彝抗击苏峻，苏峻派韩晃进攻宣城，桓彝不敌被杀，年五十三岁。之所以要多讲这一句，是因为桓彝是桓温的父亲。

陶侃率领的西路勤王大军到达石头城，但出师不利，屡战屡败。东路勤王部队由王舒、虞潭率领，同样屡战屡败。在这紧要关头，雍州刺史魏该又去世了，让勤王军原本就不乐观的形势雪上加霜。

祖约手下将领私自勾结后赵，后赵命汲郡太守石聪率军渡过淮河，进攻寿春。七月，寿春陷落，祖约弃城逃往历阳，石聪掳掠了寿春两万多户人家后返回。

祖约的失败，让苏峻部队的军心开始动摇，但即便这样，陶侃这边的进攻也还是无法取得进展，双方处于拉锯状态。久攻不下，勤王军内部也出现了怯敌的情况。

温峤军队缺粮，向陶侃借粮，这时陶侃已有了回军的想法，因为再这样下去，盟军有瓦解的趋势。这时候，庐江郡太守毛宝自告奋勇，他对陶侃说道：“请您给我派些部队，我去攻击叛贼的粮库，如果我失败了，您再走也不迟。”陶侃应允。

毛宝率军奋力攻击，烧毁了苏峻在句容、湖孰的粮食储备，陶侃一看胜利有望，决定留下。

敌将领韩晃、张键等猛攻大业大营，营中断水，将士们把粪便绞出水来解渴，顽强坚守。陶侃准备发兵救援大业，长史殷羡道：“我们的士兵大都是水兵，不擅长陆战，到时候如果不能取胜，军心就会瓦解了。不如我们猛攻石头城，这样大业的包围自然就会解除。”

九月二十五日，陶侃亲率水军向石头城发起猛攻。庾亮、温峤、赵胤等率领一万步兵从白石垒南下，但赵胤军队被苏峻派出的苏硕（苏峻之子）和部将匡孝率军袭击，大败。

苏峻正在犒劳将士，已经有几分醉意，他远远地看到赵胤军狼狈逃窜，大笑道：“匡孝能破敌，难道我还不如他吗！”他借着酒劲，只带了数个骑兵就发动攻击，但根本无法冲入阵营。苏峻准备返回，正在这时，他的坐骑突然被绊倒，说时迟那时快，陶侃的部将彭世、李千抓住时机投出手中长矛，长矛疾如流星，苏峻应声倒地，众将士一哄而上，把苏峻剁成肉酱，众将士还不解恨，又把苏峻的尸体焚烧成灰。三军将士得知敌首被诛，兴奋地高呼万岁。

苏峻的司马任让等人推举苏峻的弟弟苏逸为头领，关闭城门顽抗。韩晃听说苏峻已死，也不再围攻大业，撤回石头城。赵胤进攻历阳，祖约不敌，连夜率领亲兵数百人投奔后赵而去。

咸和四年（329）二月十三日，盟军进攻石头城，韩晃等弃城逃跑。此战，温峤带兵斩杀苏硕，之后勤王部队又生擒苏逸，将其斩首示众。曹据怀抱年幼的晋成帝司马衍投奔温峤。劫后余生，一众文武官员都跪倒在地痛哭流涕，请皇帝治他们护驾不力之罪。朝廷赦免了他们，只有投靠了苏峻的西阳王司马羕和他的两个儿子、一个孙子，以及彭城王司马雄被诛杀。

司徒王导进入石头城，命人寻找他之前慌忙出走时没有来得及带上的符节，陶侃调侃他道：“苏武的符节可不是这样拿的！”王导面露惭愧之色。

勤王军乘胜追击，把韩晃等全部杀死，苏峻、祖约之乱被全部平定。

三月十日，朝廷论功行赏，封陶侃为侍中、太尉、长沙郡公，兼都督荆、雍、梁、交、广、宁六州诸军事；郗鉴为侍中、司空、南昌县公；温峤为骠骑将军、开府仪同三司，加授散骑常侍、始安郡公。其他有功之人也各有赏赐。

陶侃返回荆州刺史总部江陵，后来他觉得江陵位置偏僻，把总部迁到了巴陵（今湖南岳阳市）。温峤也回到了江州刺史府所在地武昌。

庾亮见到成帝时，把头磕到地面，磕得噔噔作响，请求成帝降罪。但庾亮毕竟是成帝司马衍的亲舅舅，打断骨头连着筋，司马衍原谅了他，还任命他为都督豫州、扬州、江西、宣城诸军事，兼任豫州刺史，领宣城内史职，镇守芜湖。