祁弘带领部队进入函谷关后，成都王司马颖看大势已去，仓皇逃奔到新野（今河南新野县）。司马越命令南中郎将刘陶前去捉拿司马颖，司马颖不敢停留，北渡黄河逃到朝歌（今河南淇县）。在这里，他召集了属下几百人，准备去投靠旧部公师藩。走到半路，他们一行被顿丘（今河南清丰县）太守冯嵩抓住，冯嵩不敢擅自处置，便把他们押送到邺城，交给了范阳王司马虓。司马虓不忍心杀害这个先帝最喜欢的儿子，只是把他暂时关押了起来。

公师藩准备自白马津（今河南浚县）南渡黄河，遭到兖州刺史苟晞的拦截，混战中被杀死。

永兴三年（306）十月，范阳王司马虓暴病而亡，年三十七岁，死因不得而知。因为过去司马颖在邺城拥有巨大声望，长史刘舆怕司马虓的死讯传开后会引起巨变，所以秘不发丧。为绝后患，他派人假冒钦差，赐死了司马颖和他的两个儿子，司马颖死时年二十八岁，“八王之乱”中第六个王的生命就此终结。司马颖被俘后，他的旧部一哄而散，各奔前程，只有卢志不离不弃，司马颖父子死后，还是卢志为他们父子收尸安葬。卢志的忠贞行为得到司马越的欣赏，征召他为军咨祭酒。

司马越本也打算任用刘舆，但有人对他说：“刘舆这个人人品不好，就像油污一样，谁接近他都会受到污染。”所以刘舆刚刚到来时，司马越有意疏远他。刘舆一看自己不受待见，就暗暗努力想要出头。他是个有心人，秘密查阅了全国军事和仓库、牛马、器械、地形地貌等资料，把这些一一默记在心。当时全国形势多变，司马越经常召集属下议事，众人常常对时局一筹莫展，想不出来好的办法，这时候刘舆就会站出来，按照之前对全国军事等的了解，分析得头头是道。司马越对他的好感更胜，变得越来越欣赏他，后来还任命他担任左长史这个重要职位，作为自己的参谋助手。

刘舆请求司马越让他弟弟刘琨镇守并州，以此加强北方的防务力量，于是司马越在请示惠帝后，任命刘琨为并州刺史。虽然刘舆的这一人事建议有私心，但从以后刘琨在后方坚持和匈奴战斗看，这一任命也是正确的。原并州刺史司马腾升任车骑将军，调任都督邺城诸军事，镇守邺城，填补司马虓去世后留下的空缺。

永兴三年（306）十一月十七日夜，惠帝司马衷在吃夜宵的时候吃了一个饼，出现了腹泻、呕吐的中毒症状，御医抢救无效，第二天在显阳殿驾崩，结束了自己四十八年的懵懂生活，后被葬于太阳陵。

是谁害死司马衷的？当时人们都怀疑是司马越，但这个问题一直没有确切答案，成了历史未解之谜。司马衷驾崩，按说该让皇太弟司马炽继位，但皇后羊献容想到自己是司马炽的嫂子，如果司马炽继位，自己就做不成皇太后了，于是打算拥立废太子清河王司马覃（司马衷的侄子，前皇太孙司马尚去世后曾被立为皇太子）。侍中华混把这十万火急的消息通知了太傅司马越，司马越立即宣召命皇太弟司马炽入宫。司马覃接到羊皇后的通知，人都已经赶到了尚书省，但突然发现气氛不对。他是个聪明人，知道保命要紧，就捂住肚子连连叫痛，称病回去了。

光熙元年（306）十一月二十一日，年方二十三岁的司马炽登基，大赦天下，是为晋怀帝。他尊奉皇后羊献容为惠皇后，让她居住在弘训宫；追封母亲王才人为皇太后；册立妃子梁氏为皇后。

太傅司马越控制了朝政，他环视天下，发现大对手司马颙还活在世上，就下诏任命河间王司马颙为司徒，命他即日回京任职。司马颙看到诏书很高兴，以为司马越不计前嫌要和自己携手共事，高高兴兴地和家眷启程赴任了，但当他们走到新安（今河南渑池县）的时候，司马越的弟弟南阳王司马模派部将梁臣在路上拦住车马，然后登上马车，把司马颙活活掐死了，同时被杀的还有司马颙的三个儿子。

八王之乱的第七个王就此丧命，大权掌握在了第八个王司马越的手中，这场司马诸王之间的纷争到这里也就结束了，持续了十六年之久。这是中国历史上最严重的皇室内乱之一，死亡人数动辄以万计，国内经济遭到严重破坏。变乱后期，朝廷已无力控制全国形势，造成大规模少数民族内迁，特别是成汉和汉赵这两个少数民族政权的建立，更是为西晋敲响了丧钟。