王濬进入建业的第二天，王浑才渡过长江。因为王濬不听他的调度，不等他来就先接受了孙皓投降，王浑那叫一个羡慕嫉妒恨。他怒火中烧，向司马炎上奏历数王濬罪状。王濬的别驾何攀劝王濬把孙皓送到了王浑处，事情才有所缓解。

但没过多久，王浑又要上奏，请朝廷治王濬的罪，扬州刺史周浚劝他他不听，继续上书司马炎说王濬违反诏命，不服从命令，还捏造事实诬告王濬。

王浑和司马家关系特殊，他老爹王昶（chǎng）是由司马懿推荐到曹魏任职的，后来官居司空，王浑的儿子王济和司马炎的女儿常山公主又是夫妻，所以王浑家在朝廷树大根深。王濬在朝中却没有什么势力，没有人替他说话，于是有关部门就上奏皇帝，请求用囚车把王濬押解回京问罪。但司马炎心里跟明镜似的，知道王浑嫉妒王濬抢了头功，于是只是不痛不痒地责备了王濬，并没有治罪于他。

王濬也不会坐以待毙，他上书为自己申辩：“我于三月十五日到达三山的时候，王浑的军队驻扎在长江北岸，王浑写信让我去他那里商议事情，没有提及我应当受他节制的意思。当时我的水军正顺风航行，没有办法调转船头。我在中午时到达建业，黄昏时分才接到受王浑节制的虎符，他命我于次日率部队回师去包围石头城，又命我立即递交巴蜀军队和镇南军队的名册。那时我认为孙皓已经投降，没有必要再去包围石头城，另外因为将士众多，全部登记造册也不是一时半会就能完成的，而且这也不是眼下最紧迫的事情。江北的部队不了解建业虚实，不及早渡江来捉拿孙皓，是他自己的失误造成的。我首先得到孙皓，没料到会遭到嫉妒与怨恨。臣愚鲁地认为：假如有利于国家，无论生死都要尽全力。如果顾虑别人的猜忌怀疑就逃避责任不做事，以此避免可能受到的处罚，是自私自保的，实在不是君主与国家之福。臣一片赤诚之心，望陛下明察！”

王浑又向司马炎递上周浚的书信，说：“王濬军队搜刮了吴国的不少奇珍异宝。”又指控道：“王濬的牙门将李高放火烧了孙皓的宫殿！”

王濬只能又上书申辩：“我身单势孤，与势力强大的豪门结下了仇怨。如果是冒犯了君王还可能挽回，但要是得罪了权贵，灾祸就难以预料了。据前吴国中郎将孔摅说，二月武昌失守的时候，孙皓巡视石头城回到建业，左右侍从都挥舞着刀大呼：‘正要为了陛下去决一死战！’孙皓非常高兴，就把他的金银财宝全都拿出来赐给了这些人。然而这些小人得了值钱的东西就飞快地溜走了，孙皓见状非常恐惧，这才准备投降请罪。然而孙皓派出的使者刚离开，他手下的人就开始抢夺财物，掠夺孙皓的妻妾，放火烧了宫殿，孙皓抱头鼠窜，唯恐逃之不及。我到那里时，才派参军把火扑灭。周浚第一个进入孙皓的宫殿，王浑又第一个登上扣押孙皓的船，我进去和我所见到的，全都在他们之后。我进去的时候，孙皓的宫里连个可以坐的席子都没有，假如真有遗留下来的珍贵之物，也是周浚与王浑先得到了。周浚等人说我聚集蜀人，不及时把孙皓送去，是想谋反。他们还挑拨吴人，说我要把他们都杀了，把他们的妻子儿女都抓走，希望吴人作乱，以发泄他们的私恨。像谋反这种大逆不道的罪名，他们尚且用来加到我的头上，其他的诽谤与诬陷就更不用提了。今年平定了吴国，是国家大喜的日子，但是对于我个人来说，却蒙受了不白之冤。”

王濬到了京师洛阳后，有关部门仍不肯放过他，说他违抗诏命，极不恭敬，请求把他交付廷尉依法治罪。司马炎不准。他们又上书，说王濬在赦免了吴人之后还放火烧了吴人一百三十五艘船，应立即下令把他交付延尉调查。司马炎又下令，不准调查王濬。

王浑与王濬争功不已，司马炎便命令守廷尉刘颂来调查评定。刘颂评定王浑立了上功，王濬是中功。司马炎认为刘颂判定不合理，明显偏袒王浑，就把他降职为京兆（今陕西西安市）太守。

咸宁六年（280）五月，司马炎大封有功之臣：增加贾充封邑八千户；任命王濬为辅国大将军，封襄阳县侯；封杜预为当阳县侯；封王戎为安丰县侯；琅琊王司马伷的两个儿子被封为亭侯；京陵侯王浑晋升公爵；关内侯张华晋封为广武县侯；其余各位将领以及公卿大臣以下的官吏，受到的赏赐各不相同。司马炎还派人到羊祜庙里，向他的塑像宣读了平灭东吴的告书，又封羊祜的夫人夏侯氏为万岁乡君，食邑五千户。

王濬觉得自己立下头功，却遭到了王浑党羽的打击，因此极其郁闷，每次晋见司马炎的时候，都要陈述他战斗的辛苦以及自己被冤屈的情况，有时候忍不住悲愤之情，甚至会拂袖而去。司马炎脾气好，总是宽容他，原谅他。

益州护军范通对王濬说：“你的功劳确实很大，但遗憾的是，你做的事并非尽善尽美。你胜利回京之后，应当脱下戎装，闭门谢客，嘴里不谈平吴之事。如果有人问到平吴的事情，你就要说：‘这是陛下的圣明，是各位将帅共同努力的结果，我这个老头子又能有多大贡献？’蔺相如就是用这个办法把廉颇降住了，王浑听到后他能不惭愧吗？”

王濬说：“我这样做也是有原因的！我吸取了邓艾事件的教训，总怕惹祸上身，所以要竭力争辩，但是我最终也不能放开这件事，还是我的心量不够大啊。”

博士秦秀等人一起上书，替王濬叫屈，认为对他的封赏不够。司马炎于是又授予王濬镇军大将军的官职，加任散骑常侍，兼后军将军。

王濬没有再和王浑发生什么冲突。他此后锦衣玉食，奢侈纵乐，注重安逸享受。他向朝廷推荐的人也多是巴蜀人，表示不遗忘故旧。后来王濬又转任抚军大将军、开府仪同三司，加授特进（上朝时候位置仅次三公）。

到太康六年（285）的时候，王濬去世，年八十岁，谥号“武”，葬于柏谷山。