36 当初，皇帝萧昭文被废黜时，皇太后出居鄱阳王萧锵故第，号宣德宫。十二月九日，萧衍以宣德太后名义下令，追废萧宝卷为东昏侯，褚皇后及太子萧诵都废为庶人。任命萧衍为中书监、大司马、录尚书事、骠骑大将军、扬州刺史，封建安郡公，依晋朝武陵王司马遵承制前例，百官致敬；任命王亮为长史。
十二月十二日，改封建安王萧宝寅为鄱阳王。
十二月十三日，任命司徒、扬州刺史、晋安王萧宝义为太尉，兼领司徒。
十二月十九日，萧衍入屯阅武堂，下令大赦。又下令：“凡是过去不合理的制度和赋税、滥用的刑罚、过度的劳役，都要详细检讨最初的原因，全部废除。主事者离开岗位时，各种开支报销，没有及时办理的，要列清账目，按原例办理。”
又下令：“普查尚书省各部门，东昏侯时期司法不公及主管官员推诿积压、没有及时施行者，精加讯辨，依照事实奏明。”
又下令：“收葬义师及叛军死者。”
潘妃有国色，萧衍想要留下她，问侍中、领军将军王茂意见，王茂说：“让齐国灭亡的，就是这个东西，留下她，恐怕招外人议论。”于是将她缢杀于狱中，并诛杀嬖臣茹法珍等。以宫女二千人赏给将士们。
十二月，萧衍任命辅国将军萧宏为中护军。
【华杉讲透】
司法公平公正是当政者的基本责任
萧衍入宫伊始，下令大赦，废黜暴政，收葬死者，都是题中应有之义，但是，马上普查司法，处理冤案和积压未决的案件，就体现出一个统治者的格局。汉光武帝刘秀，就是在自己事业草创时期，还只有一块小小的地盘的时候，就不只是关注军事，还亲自主持司法公平正义。而这正是在乱世中人民所盼望的，这也是一个当政者最基本的责任。
至于王茂说潘贵妃是南齐亡国原因，那是血口喷人了，萧宝卷之亡，与潘妃何干？可怜步步生莲的美人！
萧衍东下时，豫州刺史马仙琕拥兵不归附萧衍，萧衍派他的故人姚仲宾前往游说，马仙琕先为他设酒接风，然后将他在军门斩首示众。萧衍又派他的族叔马怀远前往游说，马仙琕说：“大义灭亲。”又要斩他，军中为他求情，才得以免死。萧衍到了新林，马仙琕还在长江西段每日抄掠运输船只。
萧衍包围宫城，各州郡都遣使请降，唯独吴兴太守袁昂守卫郡境，拒不受命。袁昂，是袁顗之子。
萧衍派驾部郎、考城人江革写信给袁昂说：“根本已经倾覆，枝叶何处安附？如今你竭力于昏主，并不足以称为忠诚。到时候家门屠灭，也不能说是孝子。为什么不幡然醒悟，自招多福？”袁昂回信说：“三吴内地，不是用兵之所；何况我以偏隅一郡，又能做什么？您旌旗所指之处，无不**脊背，用膝盖走到军门投降。我之所以敢于最后一个才到，正是因为我平凡庸劣，既不能文，也不能武，就算我加入，也不能增大军之勇；而不理会我的愚昧和沉默，也不会沮丧众军之威。幸而凭借将军宽宏大量，让我得以从容尽礼。我私底下认为，就算是一餐饭的微薄施恩，也要杀身以报，更何况食人之禄？而一朝之内就忘记，不仅舆论认为不可，恐怕明公也要鄙视我吧？所以踌躇，未及口衔璧玉，开城投降。”
袁昂问时事于武康县令、北地人傅映。傅映说：“当初，元嘉末年，发生开天辟地以来未有的大事（指刘义隆被儿子刘劭格杀），所以太尉杀身以明节（袁昂的叔父袁淑，死于刘劭之手，事见公元453年记载）。司徒（袁昂的父亲袁顗）身当皇帝寄托之重，理无苟全，所以不顾危险，以循名义。如今嗣主昏虐，毫无悔改之意。荆州、雍州协同并举，乘据上流，天意人心可知。愿明府深切考虑，以后不要后悔。”
等到建康平定，萧衍派豫州刺史李元履巡抚东士，嘱咐李元履说：“袁昂是名门之后，世有忠节，天下人都应该包容他，不要以兵威凌辱。”李元履到了吴兴，宣萧衍旨意。袁昂也不请降，开城门撤去守备而已。
马仙琕听闻宫城失守，号泣对将士们说：“我受人之托，义不容降，君等都有父母，我做忠臣，你们做孝子，不好吗？”于是遣出城内全部士兵出降，留下壮士数十人，闭门独守。过了一会儿，萧衍的兵进来，包围数十重。马仙琕令战士都拉满弓弦，外面的兵不敢接近。到了日暮时分，马仙琕把弓扔在地上说：“诸君但来见取，我义不降！”于是将他装进槛车，送到石头城。萧衍把他释放，让他等着袁昂到了，一起进见，说：“今天让天下人见见两位义士。”萧衍对马仙琕说：“管仲射中齐桓公衣裳带钩、勃鞮斩断衣袖，都是古人的美谈。你不要因为曾经杀死我的使者，截断我的运输，就于心不安。”马仙琕道歉说：“小人就像一条丢失了主人的狗，新主人饲养我，我就再为新主卖命。”萧衍笑，对二人都优厚待遇。
十二月二十六日，萧衍入镇皇宫。
37 萧宝卷的安成内史刘希祖既攻克安成，移檄湘州，始兴内史王僧粲响应。王僧粲自称湘州刺史，引兵袭击长沙。离城还有一百余里，湘州郡县兵皆蜂起以响应王僧粲，唯独临湘、湘阴、浏阳、罗县四个县还在。长沙人都想泛舟逃走，行事刘坦把舟船聚齐在一起，全部焚毁，派军主尹法略拒战王僧粲，战数不利。前湘州镇军钟玄绍秘密集结士民数百人，约定日期，翻墙出城响应王僧粲。刘坦听闻这个阴谋，假装不知，到了那一天，刘坦审理诉讼，一直到晚上，还不关闭城门，故意让钟玄绍起疑。钟玄绍没有发兵，到了早上，钟玄绍找刘坦问为什么没有关城门，刘坦留下他，谈话很久，秘密派亲兵搜查他的家。钟玄绍还在座，而抄家的士兵已经回来报告，搜出他们密谋的文书本末。钟玄绍俯首伏罪，就在座位上被斩首。刘坦焚毁其文书，余党一概不问。众人既羞愧，又服气，州郡于是安定下来。
尹法略与王僧粲相持数月，建康城平定，杨公则回到本州，王僧粲等散走。王丹为郡人所杀，刘希祖亦举郡投降。杨公则能克制自己，清廉谨慎，轻刑薄赋。很快，湘州人口就恢复到战前旧观。