1941年12月7日，珍珠港美军基地受到日本海军、空军的偷袭。这次的奇袭从战略上来说是相当成功的。但是在袭击前日本并未对美国发出照会，这种偷袭行为引起美国人的震怒，激发美国人的战斗意识，全国都高喊着：“不可忘掉珍珠港！”

听到美日宣战的消息，在华盛顿情报部撰写新闻的杰克再也忍不住了，于是自愿参加海上勤务。不久，他的派令下来了，这次给他的新任务，是保护南部的军事工厂，以免受到敌机的轰炸。

这个工作实际上也是个闲差，这让杰克感到十分失望。忍耐了几个月之后，杰克再一次向海军部申请到前线作战。

1942年夏天，杰克等待好久的消息终于传来了。长官把他叫去说：“肯尼迪，你这次被派到海军士官训练学校去受训，你长久以来的心愿，终于快要实现了。”

杰克太高兴了，他兴奋得几乎要喊“万岁”。他紧紧握着长官的手，以表达自己的感激及喜悦之情。杰克进入训练学校后不久，军队就开始募集自愿担任PT艇艇长的人选。

PT艇是一种鱼雷艇。杰克一听到PT艇，就想到去年夏天他在驾驶游艇时，曾在海上看到过PT艇的英姿。他多么希望能指挥那种鱼雷艇与日军作战。担任PT艇艇长的资格必须是在学校里成绩优良，曾经是运动选手，有操纵游艇经验的人。

庆幸的是肯尼迪正好符合这三个条件，因此，他很轻松地通过了考试。然后，就被调往纽约附近的梅密尔基地，肯尼迪就是在这儿接受鱼雷战技的训练。

在梅密尔基地，无论是军官或士兵，都同样睡在长方形的军营中。他们在这里接受鱼雷发射、大炮的发射、航海术及有关工学的知识。通常训练在凌晨就开始了，除了以上项目外，还有体操、跑步等体能训练，偶尔也会在繁重的练习中玩一下足球作为调剂。

来自伊利诺伊州的乔治·罗斯少尉注意到了杰克，从此两个人就成为要好的朋友。八个星期的训练很快就结束了。肯尼迪的成绩相当优秀，因此被留下来担任教官。杰克原以为训练完毕，可以马上到前线作战，谁知这次还是被留下来了。他非常失望，但还是遵守命令，担任教官，而且把分内工作做得很好。后来肯尼迪当选为美国总统后，担任海军副司令的波尔·B.费伊就是在这个时候认识杰克的。