日清工作法有着科学的工作程序：确立目标，实施工作，检查完成情况，最后还要进行工作总结。日清工作只有按照这样的程序运行，才能发挥基础管理的真正威力。

按照日清管理系统，“日日清”的运行分三段九步。其中，第一段包含三个步骤：

1.制定目标和要求。在工作开始前召开例行会议，明确当天的目标及要求。

2.按目标和要求工作。生产系统按七项日清要求进行生产，职能系统针对七项日清，按“5W、3H、1S”的要求，实行瞬间控制。

3.填写日清表。由主管每2小时公布一次巡视中发现的问题及处理意见。

第二段，即按组织体系进行班后的纵向清理，分五步：

1.自清。所有岗位的员工对当天的工作按日清的要求逐项清理，生产岗位填写3E卡交组长，管理岗位填写日清工作记录交部门主管。

2.考核。由组长根据一天对每人各方面情况的掌握进行考核确认，然后报部门主管。

3.审核。由部门主管根据当天对各组长情况的掌握，复核各组的3E卡，其本人则要填写“日清工作记录”报部门经理。

4.汇总。部门经理审核“日清工作记录”，登记本部门日清台账，并将当天职能分管工作中出现的问题、解决的措施、遗留的问题、拟采取的办法等，汇总报给公司经理助理。

5.上报。公司经理助理复审后签署意见和建议，反馈给各部经理，再由各部经理汇总报总经理。

第三段是总结归纳，即由各职能部门会同有关部门、有关岗位，对“日清”过程中反映出的问题进行分类分析，并在提出解决措施的基础上，制定和完善相应的管理制度，提高薄弱环节的目标水平，并将这些经验作为下一循环的依据。