中华人民共和国成立后，我国高等教育事业处于百废待兴的状态，高等教育发展模式的转型和高等教育的大规模调整对彼时的高等教育理论研究及高等教育学学科思想的萌芽产生了重要影响。以1966年“**”的开始为分界线，我们将高等教育学的萌芽阶段分为两个子阶段。第一子阶段为1949年至1966年上半年，中华人民共和国成立初期，还没有系统形成高等教育学的学科概念，翻译和介绍苏联高等教育经验成为高等教育理论研究的重点，同时，不少高校的教师、干部对高等教育事业发展中的一些问题进行了研究与争论，对高等教育理论的探索、对高等教育学学科创建的理论研究在曲折中前进。第二子阶段为1966年下半年至1976年，即“**”时期，这一时期的高等教育事业遭到破坏，高等教育理论研究停滞，高等教育学的创建遭遇严重困难。