首先是儒学的日本化。山崎闇斋（前述）初学朱子学，后受伊势神宫神官度会延佳和主张神儒一致的神道家吉川惟足的影响，倡导一种儒学和神道折中的垂加神道（垂加是山崎的别号）。它以阴阳五行之理为经，居敬穷理之说为纬，将其权威求诸《日本书纪》神代卷的尊信；旨在守护皇室。主张“天御中主尊”相当于朱子学的“理”，由此出发，和“气”的“阴阳”一起产生万物的“理”就是“天御中尊”。因此，由祈祷和祓禊（祓除不祥）清净内心，“五伦”即明，“齐家治国平天下”即成。