正如我们之前指出的那样，从任何政治角度来看，古帝国和新帝国的玛雅城邦显然都不是真正的帝国。尽管整个尤卡坦半岛毫无疑问是由一种共同的文化、共同的语言和共同的宗教维系在一起的，但这片土地上从来没有出现过法老、恺撒或者皇帝这样的统治者。也许历史上最接近玛雅古帝国和新帝国的政府类型是公元前6世纪至公元前2世纪希腊斯巴达、雅典和科林斯组成的城邦联盟，或是公元13世纪至公元16世纪意大利威尼斯、热那亚和佛罗伦萨组成的城邦联盟，又或是在公元13世纪至公元16世纪由吕贝克、汉堡、不来梅等几个德意志城市组成的汉萨同盟，这些联盟或同盟都由一种共同的文明连接在一起。在这几种情况下，联盟或同盟的人民说着共同的语言，信仰共同的宗教，联盟或同盟成员在文化上同质，但在政治上却互相独立。

根据新帝国已知的情况，我们可以推断玛雅古帝国由若干独立的城邦组成，这些城邦相对松散地结合在某种形式的联盟中，就像公元11世纪和公元12世纪的新帝国一样。在文化、语言、宗教等方面存在如此严密连续性的地方，政治制度一定也存在相应的连续性，所以玛雅古帝国也是某种松散的城邦联盟。这个推断是完全合理的，而其他的推断都不合逻辑。

根据考古证据，例如古帝国不同地区的雕塑、建筑和陶器上的各种细微差别，表明古帝国存在相应数量的考古学意义上的分区，或许我们可以进一步大胆猜测，这些考古学意义上的分区最开始的时候可能都是一个政治独立的城邦。我们已经了解到，在新帝国末期有三个这样的主要政治实体：奇琴伊察、乌斯马尔和玛雅潘。但在古帝国也许至少有四个这种分区：（1）古帝国核心地区，包括危地马拉佩滕中北部、坎佩切南部、墨西哥和英属洪都拉斯，都城应该是最大的城市蒂卡尔；（2）乌苏马辛塔河流域，首府可能是帕伦克、佩德拉斯内格拉斯或亚斯奇兰，也可能这三座城市轮流作为首府；（3）东南部地区，首府是科潘；（4）西南部地区，主要的政府中心可能是托尼纳。